普外科设有肝胆胰、胃肠外科、甲状腺及乳腺病、腹腔镜等专业。其中，中西医结合胆胰外科是福建省重点专科、厦门市中西医结合胆胰（腔镜）外科重点专科。科室现有医护人员26人，其中高级职称4人，中级职称4人，初级职称18人，硕士研究生3人。科室技术力量雄厚，人才梯队配置合理，普外科医生均经过微创外科专业培训。
目前开展的手术有：甲状腺癌根治术、甲状腺次全切除术、乳腺癌根治术、高位胆管癌手术，肝胆道肿瘤介入治疗，十二指肠镜下的胆道支架置入术，胰十二指肠切除术，胃癌扩大根治术，结肠癌根治术，直肠癌根治术，低位直肠癌保肛手术，重症胰腺炎手术，肝硬化门脉高压症的断流及分流手术，胆囊结石及肝内外胆管结石手术。微创外科是当今世界外科发展的前沿，普外科近些年大量开展了腹腔镜下胆囊切除术、胆总管结石取石术、甲状腺瘤切除术、结直肠癌根治术、胃穿孔修补术、脾切除术、疝修补术、肠梗阻粘连松解术。
科室主要仪器、设备有美国进口史赛克公司高清晰腹腔镜（三套），日本进口奥林巴斯公司胆道镜、胰十二指肠镜，美国强生公司超声刀，泰科公司智能双极电凝刀，国产全套高清晰模拟腹腔镜训练设备，床头心电监护仪等。
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