肝外科目前共有50张床位，现有医务人员20人，其中主任医师1名、副主任医师3名，主管护士2名。肝外科包括肝脏外科专业和胆道、胰腺外科专业，主要病种为各种肝脏肿瘤和各种胆道和胰腺疾病。
肝脏外科专业：主要诊治各种肝脏肿瘤。肝脏肿瘤的诊疗手段主要为手术治疗，其次是原发性小肝癌和复发性小肝癌的物理性微创治疗，再次为中晚期肝癌的中医中药治疗。十年来已诊治的各种肝脏肿瘤的病例超过1000例。本科的特点：①肝脏恶性肿瘤的治疗方面特别注重病人肝脏的储备功能，根据不同的肝功能状况选择不同的治疗方法，如手术或微创治疗。②原发性小肝癌和复发性小肝癌的根治性的物理微创治疗，是全市各大医院中肝癌的微创射频治疗和微波治疗最多的科室。③对肝脏良性肿瘤全部采用非手术性的微创治疗。
胆道、胰腺外科专业：胆道、胰腺外科专业是主要以现代内镜外科（不需要“开刀”手术）为特色，用微创的方法解决胆囊、胆道和胰腺的疾病。胆胰微创手术后体表无大的切口，术后无需放置 “T”型管，具有创伤小、恢复快、效果好等优点，它是利用十二指肠镜（治疗性ERCP）、腹腔镜、胆道镜来完成的。其中ERCP是在静脉麻醉下利用电子十二指肠镜自患者口腔对胆道、胰腺疾病进行诊断和治疗，如：进行Oddi括约肌切开、腔内胆管碎石、取石；胆管引流等。目前我院共完成各类治疗性ERCP 1300多例，为我省开展最多最早的单位之一，所开展的某些治疗填补了省内空白，“三镜联合微创治疗胆胰疾病”科研项目获2005年获厦门市科技进步奖。
几乎所有的胆道和胰腺疾病都是治疗性ERCP很好的适应证，如胆道结石、梗阻性黄疸、胆道蛔虫、胆道肿瘤、急慢性胰腺炎等。能极大避免胆道结石的残留与复发；对于晚期胆道肿瘤，通过胆道支架置入，提高了患者的生存质量；能早期解除急性胰腺炎的病因，降低了急性重症胰腺炎的死亡率。
目前我院聘请上海东方肝胆外科医院吴伯文教授为肝病中心肝外科“特聘专家”。吴伯文教授每月来我院看门诊，参加查房和手术，全面指导肝病中心肝外科的临床工作。
中医院肝外科的特长：
1、 ①原发性小肝癌和复发性小肝癌的根治性的物理微创治疗，即不开刀根治肝癌是全市各大医院中小肝癌的微创治疗例数最多，技术最为成熟科室。②肝脏良性肿瘤的微创治疗。
2、 在胆道和胰腺疾病的诊治方面，采用ERCP的内镜技术，用十二指肠镜以极小创伤的方式解决各种胆道疾病和胰腺疾病。在省内可以说是ERCP诊治胆胰疾病最多、技术最为成熟。
