复旦大学附属儿科医院厦门分院（厦门市儿童医院）眼科成立于2014年6月1日。目前，眼科共有医务人员7名，其中主任医师1名，住院医师2名，主管护师2名，眼科技师2名。硕士及以上研究生学历4名，科室成员目前担任亚太白内障屈光手术医师协会成员，福建省医学会眼科分会眼视光与小儿眼科学组委员；厦门市医学会眼科分会委员；厦门市儿童眼保健协作组成员。
科室目前拥有免散瞳眼底照相机、综合验光仪、非接触式眼压计、电脑验光曲率计、双目间接眼底镜、婴幼儿选择性注视检测卡、视动性眼震仪、点状视力表等诊疗设备。可为临床提供规范化的儿童医学验光，婴幼儿的视功能检查，早产儿视网膜病变筛查，斜视，弱视，屈光不正（近视、远视、散光）矫正，儿童常见眼病、多发病的诊治（如结膜炎，新生儿泪囊炎、干眼症）等服务。
未来，科室将进一步提供儿童近视防控诊疗，包括：角膜塑形镜（OK镜）、硬性透气性角膜接触镜（RGP）和框架眼镜验配；开展Retcam早产儿、新生儿及婴幼儿视网膜病变检查；开展儿童眼科疾病诊断检查，包括：视野、角膜地形图、眼科A超、B超、视觉电生理和眼底光学相干断层成像检查（OCT）等。将进行全麻下斜视手术、眼球震颤矫正术、眼睑整形手术、先天性白内障摘除术、早产儿视网膜病变的激光光凝治疗、斜视和弱视训练等服务。
