该科成立于1987年，收治出生至28天的新生儿。目前中心拥有进口远红外抢救台、多功能呼吸机、多参数监护仪、床边X 线摄片机、暖箱、新生儿高压氧仓，微量输液泵等先进的监护治疗设备，中心为全封闭管理病区，配有专业的医生及专业护士，是一个训练有素的医护队伍， 中心设有早产儿区、重症监护区、疾病恢复区、配奶区、洗婴区及配药区等。目前床位20张，主任医师一名，副主任医医2名，主治医师5名，住院医师3名。中心主任林素莲为我市医学会儿科专业委员会主任，省医学会儿科分会委员，主任医师，院专家组成员。
2004年新生儿急救中心以全省最高分通过省卫生厅验收，加入全省新生儿急救网络，承接厦门地区及周边地区的危重新生儿救治任务。中心在危重症新生儿的抢救、早产儿尤其是极低出生体重儿的治疗护理等方面积累丰富经验，处于厦门闽南地区的先进水平。开展了肺泡表面活性物质治疗肺透明膜病、缺氧缺血性脑病及康复治疗、胎粪吸入综合症等在内的最新治疗及急救技术，在早产儿的体温、呼吸、体液、胃肠内外营养管理等方面有一套完整的诊断、治疗、护理方案。每年收住新生儿早产儿500余名。危重症新生儿及早产儿的抢救成功率在96%以上，成功抢救体重仅800克的早产儿。
午
呼吸治疗专科：
为我市第一个儿科呼吸专业分科，拥有床位25张，副主任医师一名，主治医师三名，其中硕士研究生两名。自1996年起率先在我市开展儿童哮喘的规范化治疗，在呼吸道疾病如哮喘、儿童睡眠呼吸障碍、反复呼吸道感染、鼻窦炎、气管炎、肺炎诊治方面积累了丰富经验，目前我科开设：重症患儿的呼吸支持，如机械通气、气管插管等生命支持、肺功能检测、过敏原检测；雾化吸入治疗、各种病原学的检查、采用标准化疫苗的脱敏治疗（我省第一家儿科过敏性疾病免疫治疗中心巳于2004年落户我科）、采用世界卫生组织推荐的全球哮喘防治创议对我市哮喘患儿进行规范化管理治疗、定期举办哮喘家长学校等。
呼吸专科收治对象：
从鼻腔至肺泡的所有呼吸道疾病，如上呼吸道感染、鼻窦炎、扁桃体炎、支气管炎、肺炎、反复呼吸道感染、哮喘等。凡有以下症状者均应到我科进行专科治疗：
1.喘息、呼吸困难患儿；
2.反复咳嗽，久治不愈者；
3.经常鼻塞、脓鼻涕、睡时打鼾、张口呼吸者；
4.经常感冒，每年超过6次以上者；
5.各种过敏性疾病：经常气喘、咳嗽、眼鼻痒、皮肤痒者；
6.发热、咳嗽、咽痛等各种呼吸道症状者。
