该科是厦门市消化疾病诊治中心，厦门大学消化疾病研究所，中华医学会消化内镜培训中心厦门培训基地。集医、教、研为一体，技术力量雄厚，现有医护人员40余人，其中主任医师5人，副主任医师4人，主治医师5人，住院医师5人，博士8人，硕士6人。拥有各种先进的诊疗及科研设备，下设病床50张、消化专家门诊、专科门诊、专病门诊、消化内镜诊疗部、消化动力室、消化实验室。年门诊量近8万人次，年出院1500人次，治愈好转率超过90％，年内镜诊疗达1.5万余人次。
门诊：共有诊室5间。开设消化专家门诊，由具有丰富的临床及内镜操作经验的专家坐诊，进行消化内科各种急危重症及疑难病例的诊治。开设消化专科门诊，进行消化科各种常见病、多发病的诊治。开设肝病、功能性胃肠疾病、HP相关疾病、胆胰疾病、消化道肿瘤、炎症性肠病及便秘等专病门诊，由专攻相关疾病的主任医师及主治医师坐诊，专病专治，提高门诊诊疗质量，快速为患者明确诊断、解除病痛。
病房：开放病床50张，拥有经验丰富、技术精湛的三级医疗队伍及训练有素的护理队伍，具备快速应对各种突发事件的能力，能胜任消化内科各种疾病的诊疗及护理工作。病房宽敞明亮、舒适温馨，使患者有宾至如归的感觉。
消化内镜诊疗部：消化内科内镜诊疗部下设胃镜室、肠镜室、双气囊小肠镜室、超声内镜室、X线室、消毒室、复苏室、动力室、胃电图室等，拥有各种先进的诊疗和科研设备如电子内镜系列、超声内镜系列、胃肠动力检测系列、双气囊电子小肠镜、胶囊内镜、氩气刀、X光机、24小时PH监测仪、24小时动态碱反流监测仪、高分辨多道全胃肠功能监测仪、消化道电子恒压及感觉阈值刺激仪、质谱仪、心电监护系统、全套多媒体教学系统等，设备精良，技术力量雄厚，为全科医、教、研工作的飞速发展提供良好的基础，同时还拥有最为完善的内镜消毒设备及程序以确保内镜诊治的安全。
