该科是福建省闽南地区第一流的神经外科治疗中心，也是集神经外科临床、教学、科研三位一体的厦门市首批医学重点学科。它下设显微神经外科、立体定向神经外科、放射神经外科、血管内神经外科、内窥镜神经外科、以及锁孔神经外科等亚专业，此外还设有中枢神经系统肿瘤、先天性疾病、脑血管病、以及脑、脊髓损伤研究课题组。神经外科瞄准和适应国际发展趋势，具有一批高素质、高学历、老中青结合的最佳学术队伍。其中教授、主任医师4名，副教授、副主任医师9名，博士4名，硕士学位6名，留学回国者2名，援非回国者１名。他们精力充沛、团结协作、善于改革、勇于创新，在省内外率先开展了多项新业务、新技术。
神经外科颅内肿瘤的手术治疗达到国内先进水平，在省内较早开展了显微神经外科的技术推广。立体定向手术治疗精神疾病、Parkinson’s病以及其他锥体外系疾病如扭转痉挛等省内领先并达到国内先进水平。射频毁损和微血管减压对三叉神经痛的综合治疗居省内领先水平，达到国内先进水平。近年来，率先在福建省开展神经导航手术、神经内镜-锁孔手术、神经内镜辅助下经鼻-蝶窦鞍区肿瘤切除术、癫痫外科、血管内介入治疗各部位脑动脉瘤及血管畸形等，同时也开展了复杂动脉瘤治疗、脑干肿瘤手术切除等神经外科难治性疾病，并取得良好效果。全科人员不断探索、开拓创新、发展并丰富了微侵袭神经外科，从而进一步提高了疗效，将患者的痛苦和费用降到最低，成为深受广大患者所欢迎的先进的神经外科治疗中心。
神经外科2009年预计将完成大中型手术近1000台。手术涵盖各种颅脑损伤、颅内肿瘤、脑血管病、脊髓肿瘤及功能性神经外科疾病。包括跨矢状窦脑膜瘤、蝶骨嵴内侧脑膜瘤、鞍结节脑膜瘤、垂体瘤、颅咽管瘤、听神经鞘瘤、哑铃型三叉神经鞘瘤、岩斜区脑膜瘤、动静脉畸形、脑动脉瘤、脑干肿瘤、髓内肿瘤等高难度显微手术。一些在其他单位未能解决的或仅部分解决的病例，经本科再次手术而得以康复。手术疗效均经CT或MRI复查所证实，预后及生存质量好，达到国内外先进水平。
神经外科以国际一流模式的装备和管理确保病人的治疗效果，全体医护人员严谨求实、精益求精、开拓进取、勇于创新，临床、教学、科研均处于本学科领域的前沿。科室成员开展的科研课题包括国家级课题三项、省部级课题五项、厦门市攻关课题五项，已获省部级科研成果三项，科技进步奖两项。在权威性学术刊物上发表论文400余篇，主编及参编神经外科专著八部。全科紧跟世界潮流，勤奋奉献，不但医德高尚，而且技术超群，吸引省内外及东南亚的病患者，为我国及地区神经外科发展做出了贡献。神经外科全体医护人员将继续努力，以“一流的技术、一流的设备、一流的服务”为宗旨，以雄厚的综合实力为患者提供领先水平的，全方位的医疗服务。
