该科自从1995年胸外科独立三级分科以来，历经7年的发展、建设，现具有编制床位 47 张，在编职工20余人，其中教授、博士生导师1人、主任医师2人，副主任医师3人，主治医师3人。其中博士生1人，硕士研究生5人。现已成为学术梯队合理，技术力量雄厚，设备先进，集医疗、教学、科研为一体的临床学科。
特色诊疗：1.食管癌诊疗：福建地区为食管癌高发区，我科在食管癌手术治疗上积累了一套丰富的经验，在全国较早开展高难度的三野食管癌根治术，成功率高，提高了食管癌病人术后远期成活率，并提高了许多较晚期病人的生存质量和生存时间。同时我们开展各种食管癌术式：不开胸食管内翻切除术、双切口、单切口食管癌根治术等。手术成功率高，在国内居领先水平。
2.微创手术：胸腔镜微创胸外科手术是我科的另一特色，较早的开展了胸腔镜下肺叶切除术、全肺切除术、肺大疱切除术，胸腔内良性病变手术，恶性胸水治疗。减少了胸科手术的创伤、减少患者的痛苦，手术成功率接近100%，属省内先进水平。2002年成功完成厦门市首例胸腔镜肺叶、全肺切除术，并完成厦门首例全胸腔镜下食管癌根治术。2002年，开展了电视胸腔镜下行胸交感神经切断术治疗“手汗症”取得较好疗效，填补医院空白，患者术后满意率100%。
3.各种高难度胸外科手术：我们在高龄患者及小儿胸外科手术处理有丰富经验，开展了200多例70岁以上高龄食管、肺、纵隔肿瘤手术，成功率达98%以上，其中最高年龄患者85岁。诊治小儿胸外科疾病患儿多名，并成功救治1名出生31小时婴幼儿先天膈疝患儿，腹腔里的胃肠脾脏等器官，全都疝入胸腔，成功还纳。
科研技术：科研创新是我们前进的动力，科室开展了一系列科研项目：国家科技部国际合作重点项目：“异源性特异性抗肿瘤基因疫苗作用机理的研究”、 国家自然科学基金项目“超急性排斥反应靶向抗肿瘤自杀基因疫苗的研究”等。在国家级、省级医学刊物发表了30余篇学术论文，在加强自身科研建设的同时，注重与外界进行广泛的学术交流活动，多次派员参加国内外学术会议。
天道酬勤，经过几年的不懈努力，胸外科已获迅速发展，目前，我科年手术量500余台，各类胸外科高难手术均能常规开展。胸外科环境优美、病房整洁舒适，护理人员热情周到、技术娴熟。病人除来自厦门及周边地市外，还有来自各个省市。在未来的岁月中，厦门大学附属中山医院胸外科人将继续勤奋钻研，优良服务，再接再厉，团结奋进，继续谱写绚丽的篇章。
