自治区人民医院神经外科成立于1984年，是自治区临床重点专科，是北京天坛医院协作中心，也是新疆医科大学、石河子医科大学的教育培训基地。科室开放床位60张，其中重症监护室设有床位6张。现有医护技人员52名，医生19人，其中主任医师4名、副主任医师7名、教授2名、副教授1名、硕士研究生导师2名、博士1名、硕士15名；护理人员31人，其中硕士2名、主任护师1名、主管护师1名；技师2人。科室年门诊量6000余人次，住院人数1600余人次，手术量1000余台。
该科在颅脑外伤、颅内肿瘤、颅底肿瘤、颅内巨大肿瘤、颅内血管性疾病（动脉瘤、动静脉畸形）、癫痫、脊髓内及椎管内肿瘤显微外科手术领域在疆内处于领先水平。在疆内率先开展闭塞性脑血管病动脉溶栓术，神经内镜下单鼻孔经蝶垂体瘤切除术，颅内动脉瘤复合手术，荧光素钠辅助诊治复杂颅内动脉瘤，颅内覆膜支架植入术，神经内镜下颅内血肿清除术，改良前颞下经天幕入路切除岩斜区、海绵窦区肿瘤等多项新技术，多次被国内知名媒体报道，受到全疆各族群众好评，极大提高了外科脑血管病诊疗水平。
2009年至今，该科承担并完成国家自然科学基金项目、吴阶平医学基金会临床科研专项资助基金项目自治区“十一五”科技攻关和重点科技项目、自治区自然科学基金资助项目等6项科研课题，荣获自治区科技成果奖1项。发表论文40余篇，其中SCI收录4篇。
