高血压诊断治疗中心是继上海高血压研究所之后，我国省级综合性医院的第一个高血压专科，是我国西北地区的第一个高血压专业研究和医疗机构。
高血压科于1997年创立，由国务院特殊律贴专家李南方博士担任科主任，2002年在此基础上被授予新疆维吾尔自治区高血压研究所，于2006年被批准为新疆高血压诊断治疗中心。
目前高血压诊断治疗中心包括临床诊断部门和科学研究部门。临床诊断部门包括：门诊、病房、继发性高血压鉴别诊断检测室、睡眠呼吸病致高血压诊断治疗室、动态血压室、运动血压监测室、动脉内压监测室等多个部门。目前月门诊量2000余人次，主要是针对高血压患者，建立个体化的治疗方案，把高血压及其合并症如：糖尿病、高尿酸血症、高同型半光氨酸血症、代谢综合征等的危害降到最低范围。病房设有50张病床，主要为难治性高血压、复杂高血压做诊断和鉴别诊断；同时为高血压并发症，如脑血管病、冠心病、心功能不全、肾功能不全等患者建立长期治疗方案。目前我中心近10年间，接诊病人60000余人次。科学研究部门设有临床检测室、循证医学室、流行病学室及分子学生物室，其中临床检测室，开展了肾素、血管紧张素、醛固酮、皮质醇、胰岛素、尿儿茶酚胺代谢产物（VMA）、脑利钠肽及血同型半胱氨酸等专科检测项目，流行病学及分子生物学室承担有国家级以及自治区级、省部级课题8项，目前已成为全疆继发性高血压临床检测中心。在全国率先开展了肾上腺静脉醛固酮、肾素水平检测等高难度检测，填补了国内空白，继发性高血压鉴别诊断率达20%。
