现配备了包括飞利浦IE33实时三维超声仪在内的4台高档彩色超声仪器，分布于门诊、病房、手术室和急诊室等。可满足常规检查，经食管超声、负荷超声、声学造影、超声引导穿刺，超声引导介入操作和术中监测、心肌组织定征、三位超声和其他特殊需要。
建院以来，保持着新疆利用超声心动图术前诊断心脏疾病的最高记录，超声心动图诊断方法的建立和提高与国家同步。2007年超声检查超过20000例，利用超声诊断先天性心脏病的种类和例数同期局新疆之首。与心外科手术比较诊断完全符合率达98.6%。超声心动图引导心血管疾病的介入治疗，与国内同步，术中超声数量亦达到新疆首位，并为心外科手术的成功提供了保障。
