卫生部北京医院肿瘤科是专门从事肿瘤药物治疗为主的综合治疗部门。最早于70年代为内科的肿瘤组，以后为了满足越来越多患者的治疗需求于1992年扩大了病床量及相应设施成立了现今的肿瘤科。
现有主任、副主任医师、主治医师、护师、技术员等，共有医务人员30余人左右。其中医生16位，硕士学位为7位，博士学位3位，与美国DUKE大学和瑞士日内瓦大学有着长期良好的学术交流。拥有床位46张，层流洁净室一套，超声聚焦治疗中心及肿瘤中心实验室。年收诊患者近千人次，年专科、专家门诊达5000多人次。肿瘤科从事肿瘤的药物治疗已有30余年历史，包括化学治疗、内分泌治疗、生物免疫治疗、最新的分子靶向治疗等都积累了丰富的经验，尤其是对于老年肿瘤有着丰富的临床经验，利用分子生物学技术了解和预测肿瘤患者的复发风险以及选择有针对性的个体化治疗方案，取得良好的疗效。现为卫生部临床药理基地，近5年来参与和完成多项II-III期新药临床试验，目前仍正在进行的研究包括治疗乳腺癌的氟维思群，非小细胞肺癌的易瑞沙(吉非替尼)和各种肿瘤中使用Avastine的临床研究试验。参与了九五攻关的实体瘤干细胞移植的研究，目前还在进行“十一五”非小细胞肺癌的规范化多学科综合治疗的多中心协作研究。
治疗特色及开展项目：肺癌、乳腺癌、恶性淋巴瘤、胃癌、大肠癌、肝癌等(术前、术后及III、IV期病人的化疗)，和放射科联合开展了介人治疗(包括肺动脉、肝动脉及其它的导管化疗、栓塞及支架置人)，独立开展实体瘤的干细胞移植术，恶性浆膜腔积液的持续引流和胸膜闭合术，PICC管的常规植入术和护理，免疫治疗和分子靶向治疗。
肿瘤中心实验室 增设了肿瘤标记物检查如：TSGF、Ag-NORs、LTA以及淋巴细胞亚群;结合临床，有助于肿瘤早期诊断，有助于对各种肿瘤治疗预后的估价及免疫功能的评定。
