该院的特色科室，是全县妇幼保健工作的指导中心，承担着全县妇幼保健、优生优育、科研、培训和技术指导等工作，拥有经验丰富、专业技术精湛的妇女儿童保健专业人员队伍。近年来，该县争取了多项惠民政策，实行免费检查或补助如宫颈癌普查、新生儿疾病筛查、预防艾滋病、梅毒和乙肝母婴传播项目、增补叶酸、孕产妇系统管理、住院分娩补助等。
妇女保健科开展了孕产期保健、青春期保健、婚前保健、生殖保健、更年期保健和妇女常见病、多发病的普查普治、乳腺疾病的防治、孕妇学校等特色专科服务。为提高妇女保健知识水平，宣传普及妇女保健、计划生育、优生优育等科学知识，同时发挥妇幼专业保健的优势，开展了盆底康复治疗、母乳成分分析、阴道镜检查、产后按摩、孕妇音乐氧吧疗法等特色专科项目。
儿童保健科开展了新生儿访视、散居儿童体检、集体儿童体检、儿童营养咨询、儿童心理咨询、视力筛查、新生儿听力和疾病筛查、新生儿沐浴、婴儿抚触游泳、育儿学校等特色专科门诊。为儿童提供定期健康检查，体格发育及健康状况评价，提供儿童喂养和营养膳食、早期综合发展、常见疾病防治、健康安全保护、健康教育与健康促进等保健指导；建立高危儿童专案管理并开展托幼机构卫生保健工作的管理和指导，每年进行入园体检及幼托机构儿童体检。
