弱视与小儿眼科成立于 2001 年，为医院的重要业务部门。承担着 18 岁以下儿童及青少年绝大部分的眼部疾患的诊断和治疗，以及各年龄组斜视患者的诊治，同时还负责儿童眼病的预防宣传工作。
斜视与小儿眼科分门诊和病房二部分。门诊位于医院一楼，主要诊治日常挂号的青少年及儿童患者和需要会诊的疑难病人，同时需要在院进行弱视训练的患者在这里可以得到高档弱视治疗仪的规范有效治疗。同视机等一系列眼肌检查也在这里完成。寒暑假期间是小儿眼科门诊量的高峰时期，每天诊治病人达 250 人次。平时平均日门诊量约为 100 人次，弱视治疗达 1500 人次 / 月。
病房设在医院九楼，固定床位 6 张，平时施行各种斜视近 40 台 / 月，高峰时期达 60 台 / 月，不仅可以施行共转性斜视，对麻痹性斜视及特殊性斜视均取得了满意效果，在深圳率先进行了先天性眼球震颤的矫治手术，并取得了较好的疗效。
小儿眼科现有医生 4 人，其中高级职称 3 人，硕士学位以上者 3 人，技师 1 人。
目前科室承担着省市级科研课题 2 项，已获省科委科技进步二等奖一项。
