针对各类心胸疾病患者，开设了心外科、心内科、胸外科、呼吸内科、放射科、病理科等15个临床医技科室，其中以小儿心脏中心、成人心脏中心、心内中心、胸腔镜中心、胸外中心为重点专科，以微创、介入和小儿先心病治疗为特色，开展治疗项目包括各种先心病的微创治疗、常规瓣膜置换、冠脉不停跳（off -pump）搭桥及停跳（on -pump）搭桥手术、完全胸腔镜下房室缺修补术、经皮冠状动脉腔内成形术（PTCA）等系列心胸手术。
