南京脑科医院精神二科是江苏省卫生厅与南京市卫生局医学重点学科、江苏省精神卫生指导中心，是中国食品与药品监督管理局新药临床试验中心，国家教委批准的硕士点，承担着南京医科大学、南京大学医学院及南京中医药大学的临床教学任务。每年接受来自全国各地医院的进修医师。目前设有两个病区（8病区和10病区），配备病床80张。现有医师12名，其中主任医师2名，副主任医师5名，硕士研究生导师3名，具有博士学位3人，硕士学位4人。科室专家担任江苏省精神科协会委员，江苏省心理卫生协会理事，南京市神经精神科协会副主任委员，部分专家曾出国深造过。
精神二科在各种精神障碍如精神分裂症，躁狂症，抑郁症、睡眠障碍、强迫症、人格障碍、酒精所致精神障碍以及器质性精神障碍等诊治上积累了大量的病例和丰富的临床经验，多项诊治水平居国内先进水平。具有良好的服务态度，优质的治疗效果，受到了省内外众多患者及家属的赞誉，以及同行的一致好评。
精神二科目前正承担国家级和省市级科研项目6项，院级科研项目2项。研究方向是利用神经生化、电生理、分子遗传学、功能磁共振、脑磁图等新技术探讨精神分裂症、抑郁症、躁狂症及强迫症的病理机制。同时负责新药上市前的各期临床研究工作，对精神科药物尤其是前沿药物的疗效及不良反应具有较为深刻的认识。该系列研究进一步提高了精神二科的科研水平和临床诊断水平。作为学习型科室，精神二科科内具有浓厚的学术氛围，定期举办科内学术研讨会，主持或参加国内、国际学术活动。每年在国际学术刊物、国内核心期刊或国内重大学术会议上发表和宣读的学术论文约20余篇，近年来参编学术著作10部。
近五年来，精神二科先后完成国家自然基金项目2项，国家科技部十五攻关子项目2项，卫生部重点项目2项，省市级科研项目10项，获得省部级奖项2项。
特色医疗
收治病种：
精神分裂症、躁狂症、抑郁症、睡眠障碍、强迫症、人格障碍、酒精所致精神障碍、器质性精神障碍等。
治疗技术：
药物治疗：适应于各种精神障碍。
物理治疗：无抽搐电休克治疗，适应于重度抑郁症和具有冲动伤人行为的患者。
伽马刀技术：适应于难治性精神障碍，尤其是难治性强迫症。
心理治疗：急性期主要给予支持性心理治疗；巩固期和维持期，主要给予分析性心理疗法、认知疗法、行为疗法、集体心理治疗和家庭治疗等；辅以工娱治疗和音乐治疗等。
优化治疗：适应于难治性精神分裂症、难治性抑郁症及难治性强迫症等。
康复治疗：包括个人生活能力康复、家庭功能康复、社交技能康复和职业技能康复等，目的是提高或恢复患者的个人、家庭、社会和职业等功能。
