该科设有纤维支气管镜检查室和肺功能测定室。目前开放床位32张，年收治住院病人700余人。科室主任邱栋发主任医师，内科呼吸专业研究生毕业，医学硕士，现任福建医科大学兼职教授、福建省医学会呼吸病学分会常务委员、福建省防痨协会理事、三明市医学会呼吸病学分会主任委员。
该科是诊治感冒、流感、支气管炎、肺炎、哮喘、支气管扩张、慢性阻塞性肺病（COPD）、肺源性心脏病、肺部肿瘤、肺结核、间质性肺病、肺栓塞、气胸、胸腔积液等呼吸系统疾病的专业科室。若有出现发热、咳嗽、咳痰、咯血、胸痛、胸闷、呼吸困难等症状，或体检发现肺部有阴影的患者，可到呼吸内科就诊。三明市第一医院呼吸内科在诊治呼吸系统疾病方面在三明市处于领先地位。
呼吸内科专业特色：
1.纤维支气管镜检查：拥有日本Olympus纤维支气管镜及配套的活检钳、毛刷、活检针、注射针、异物钳、支气管肺泡灌洗装置，对肺癌、肺结核、肺部感染、间质性肺病及不明原因的咳嗽、咯血、肺不张、肺内肿块或病灶的患者，通过纤支镜检查可明确诊断或进行有针对性的治疗。
2.肺功能测定：肺功能测定对呼吸困难的病因诊断有明显的帮助；为COPD和哮喘的诊断、病情严重程度的判断、疗效的判定及预后提供依据；可为外科手术（尤其是胸部及上腹部手术）的围手术期风险进行评估；可为各类人员的劳动能力鉴定提供客观依据。
