在原上海市传染病医院几代人的共同努力下，我科在以下感染性疾病的诊治方面有独到见解并取得较好疗效：
艾滋病：是上海地区唯一收治艾滋病的科室,擅长血友病合并艾滋病的治疗各种机会性感染和抗逆转录病毒治疗等。作为国家级艾滋病药物验证基地，在联合抗病毒治疗以及药物的不良反应及耐药基因的检测方面积累了大量的经验。
性病：梅毒、尖锐湿疣、淋病、非淋菌性尿道炎、生殖器疱疹等；
呼吸道传染病：麻疹、水痘、流行性腮腺炎、猩红热、白喉等；
消化道传染病：霍乱、伤寒、细菌性食物中毒、细菌性痢疾等；
寄生虫病：阿米巴病、弓形虫病、血吸虫等；
肾综合征出血热：擅长重型、危重型出血热的处理；
不明原因的发热：有诊治各种发热待查的丰富经验
