上海市第一人民医院心血管外科始建于1997年4月，由医院“跨世纪人才工程”中引进中华医学会胸心外科分会副主任委员肖明第教授创立并担任主任。2009年由袁忠祥主任主持科室工作。科室建立12年来，规模已发展到了40张床位，其中术后监护室7张床，成为医院重点科室;2003年依托医院的心血管学科优势，心内、心外科联合成立了上海市心脏病急救中心，该中心拥有虹口中心医院、吴淞医院等18家本市协作医院，建立了高效的急救网络，并与江浙皖赣豫等地区多家医院建立协作关系和进行技术指导。心血管外科成立至今共完成各种手术5000余例，收到了良好的社会效益。
上海市第一人民医院心血管外科是上海地区最早大规模地开展冠脉搭桥手术的单位，至今共完成搭桥手术2000余例，手术患者的平均年龄高达68.6±10.8岁(年龄最大者89岁)。在努力提高常规冠状动脉搭桥手术水平的同时，该科积极开展微创冠脉外科手术，先后开展了不停跳(off-pump)搭桥，采用U-clip缝线和symmetry静脉主动脉近端吻合器等冠脉吻合技术，此外还开展了MIDCAB以及各种小切口心内直视手术等。
瓣膜病是我国心脏病患病率最主要的病种，上海市第一人民医院心血管外科在此领域开展了大量的工作，完成了瓣膜成形及置换术、合并冠脉搭桥术共2500余例，同时还开展小切口瓣膜手术，挽救了众多晚期心脏瓣膜病人的生命。瓣膜外科病人通常合并房颤，目前已常规开展了具有国际先进水平的外科房颤消融术，获得了良好的临床效果。1999年该科在本市率先进行了机械臂二尖瓣置换手术，引起了学术界的轰动。
目前该科完成各类先天性心脏病手术近1100例，除了一般的房间隔缺损、室间隔缺损等疾病，还包括各类复杂先心病，如大血管转位、右室双出口、单心房、单心室、Ebstain畸形等;完成各种大血管手术近百例，包括Bentall术、Carbroll术、弓置换、胸腹主动脉置换、象鼻手术等疗效达国内先进水平;同时还开展先天性心脏病的介入治疗和夹层动脉瘤血管内支架隔绝术，成功率达98%以上。2000年4月完成同种心脏移植1例，存活至今，生活质量良好，成为上海存活时间最长的心脏移植患者。
近年来，上海市第一人民医院心血管外科共完成了各类国家、市、局级课题15项，培养博士后3名，博士6名、硕士12名，共发表论文305篇，参与编写专业书籍3部，主编书籍3部，申请专利3项。
