上海市肺科医院麻醉科建组于1956年，建科于1978年，经过多年建设，现已发展成为一个科室建制较完整、管理较完善、医疗设施先进、医务人员技术精湛的具有专科特色的临床二级学科，是上海市首批住院医师规化培训麻醉科教学基地。目前科内高级职称3名，硕士研究生导师1人，中级职称9人，初级职称3人，护师1人，其中博士后1人，博士4人，硕士7人，本科4人。科室擅长普胸手术病人的麻醉，每年完成胸科手术麻醉工作量5000余例，包括气道手术、肺手术、食道手术、纵隔手术麻醉等，其中重度肺功能不全麻醉、肺减容手术麻醉、气道重建手术麻醉、巨大纵隔肿瘤伴有上腔静脉综合症病人的手术麻醉、肺移植手术麻醉等边缘性疾病麻醉具有一定水准与专业特点。科室内设有麻醉苏醒室、疼痛门诊。配置有多台高档麻醉机（麻醉工作站）、多功能监护仪，另有呼吸机、除颤器、纤支镜、全面的体、肺循环监护系统和呼吸动力学监测系统、麻醉信息系统等，能满足医教研的需要。近年在全国率先大规模开展无痛纤支镜检查和治疗技术，每年完成约2000例，取得良好的社会效益。还开展全麻下气道支架置入、全麻下硬质气管镜检查和全麻下心导管检查等手术室外麻醉。麻醉科擅长处理一些疑难气道问题，对边缘性肺部疾病麻醉处理具有独到的经验。
科室主要研究方向为：围术期肺保护、胸科手术麻醉、肺移植麻醉、肺缺血再灌注损伤防治等。近年来发表论文100余篇，SCI收录10余篇。获国家实用新型专利授权6项，承担国家自然科学基金、上海市科委、上海市卫生局等各类课题10余项。
作为同济大学、徐州医学院、苏州大学硕士培养基地，每年招生研究生3-4名，承担有同济大学研究生进修班授课等教学任务。作为首批卫生部舒适化医疗基地，科室积极推广无痛纤支镜检查技术，每年举办全国继续医学教育项目“无痛气管镜检查、治疗技术新进展学习班”。
