呼吸内科是浦东新区重点学科、医院重点学科、上海市医学会呼吸分会地区学组组长单位，负责主持浦东疾病控制中心读片会工作，同时是同济大学硕士和博士研究生培养点，是上海市住院医师规范化培训基地，上海市专科医师规范化培训基地。
呼吸内科主要特色为肺部肿瘤、肺栓塞、睡眠监测与治疗、慢性气道疾病，开展低剂量CT、电子（荧光）支气管镜、炫速CT肺血管造影（CTPA）、呼吸睡眠监测、九项呼吸道感染病原体检测、门诊雾化吸入治疗等检查项目。负责多项国家药物临床研究，为患者的治疗带来了更多更好的选择。
承担政要来访、各项重大活动和赛事的医疗保障任务，参与汶川大地震、青海玉树地震等医疗救灾。科内拥有主任医师4名，副主任医师5名，主治医师9名，其中博士研究生导师2名，硕士研究生导师4名。拥有Jaeger（德国耶格）肺功能和脉冲振荡仪、Micro Medical（英国迈科）SpiroUSB肺功能仪等众多先进设备。
