深圳市第二人民医院心外科拥有目前最先进的医疗设备，如德国产Stocket Ⅲ型体外循环机、美国产BP840呼吸机、Datescope体外球囊反搏机等。是深圳地区最早开展体外循环手术的医院之一。常规开展：
1. 微创小切口心脏手术（切口仅为2～3厘米）：如房间隔缺损封堵术、动脉导管未闭封堵术等。
2. 先天性心脏疾病（房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭、法乐氏四联症、心内膜垫缺损、肺动脉狭窄、三尖瓣闭锁、右室双腔心、右室双出口等）修补或矫治术。
3. 心脏瓣膜置换术或成形术（风湿性心脏病等心脏瓣膜病，如二尖瓣狭窄、二尖瓣关闭不全、主动脉瓣狭窄、主动脉瓣关闭不全，感染性心内膜炎等）：二尖瓣膜置换术、主动脉瓣置换术、二尖瓣＋主动脉瓣双瓣置换术、再次瓣膜置换术、瓣膜成形术。
4. 冠心病：冠状动脉搭桥术（冠状动脉旁路移植术）、室壁瘤切除术。
5. 大血管疾病：主动脉瘤、主动脉夹层动脉瘤及主动脉狭窄行腔内支架置入术、马凡氏综合征矫治术、胸主动脉瘤血管置换术。
6. 心脏损伤、心脏肿瘤（心脏粘液瘤）和心包疾病等的外科治疗。
全科医护人员以“团结、爱岗、求实、拼搏”的科训为激励，克服困难，收治了多名危重病人，手术效果良好，《南方都市报》和深圳多家媒体均予以报道。
