我院儿童血液/肿瘤科创建于1973年，是国内最早建立儿童血液肿瘤专科的医疗单位之一。1984年 2007年是中华医学会儿科学分会儿童血液学组组长单位（组长廖清奎教授），目前是中华医学会儿科学分会儿童血液学组副组长单位（副组长高举教授）。1995年曾获卫生部临床重点学科建设项目的资助，1999年儿童血液肿瘤实验室成为四川省重点实验室。学科人才队伍和技术力量雄厚，已形成以中青年高学历为主体，老中青相结合的高素质人才梯队。学科是儿童血液/肿瘤专业硕士点、博士点和博士后流动站，现有教授12名，副教授2名，讲师3名，其中博导5名，硕导7名。
学科的医疗技术和科研居于国内一流水平，已成为西南地区最大的儿童血液肿瘤疾病诊治中心。每年诊治四川和西部各省儿童血液恶性肿瘤（以急性白血病和淋巴瘤为主）患者200余例。设有2个病区，病床60张，常年实际开放床位70?80张。2003年建立国内一流设备的骨髓移植层流病房，占地面积200余平方米，采用全封闭式水平层流和中央空调系统，百级层流室2间，万级层流室2间。自2004年以来已成功开展造血干细胞移植（包括脐血干细胞、骨髓干细胞、外周血干细胞）治疗重型B-地中海贫血、急、慢性白血病等患儿。
科室崇尚学术，注重临床与科研共同发展，取得了突出的学术成就和科研成果。自1980年代起一直致力于铁缺乏症、围产期母婴铁代谢的研究，率先完成了我国儿童铁缺乏症的发病率的流行病学调查，研究了缺铁对机体各器官功能的不良影响。在国内外首次提出了孕母严重缺铁可影响胎儿铁供给的“有限无私理论”，修正了孕母铁状况不影响胎儿铁代谢的传统观念，显著降低了婴幼儿和孕产妇铁缺乏症的患病率，受到了国内外学者的重视和肯定。
近年来深入开展的研究包括铁代谢异常与慢性病贫血及白血病等疾病关系的研究；急性白血病分子发病机制和耐药机制的研究；地中海贫血基因治疗和临床研究；输血与免疫抑制的研究。学科研究水平一直处于国内领先地位，先后获得国家自然科学基金、卫生部基金和省部级科研基金30余项。在缺铁性贫血、母婴铁代谢、儿童白血病、地中海贫血等基础和临床研究领域获得国家科技进步三等奖1项、卫生部科技进步三等奖1项、四川省科技进步成果奖20余项。学科与香港理工大学、香港中文大学、香港大学、美国St.Jude 儿童研究医院、美国华盛顿大学医学院在铁代谢紊乱与血液肿瘤疾病、造血干细胞移植、红细胞造血等领域建立了长期人才培养，学术交流和合作的联系。
科室设有儿童血液肿瘤研究室，是卫生部重点学科建议项目和四川省重点实验室，是集临床和基础研究于一体的实验中心和研究生培养基地，投入使用400多万研究细胞形态学、免疫学、细胞遗传学、分子生物学、细胞生物学等先进的实验技术设备，包括正置荧光显微分析系统NIKON90i、倒置荧光显微分析系统Olymbus CKX41、流式细胞仪BD FACSAir、millipore Elix 3/milli-Q、电穿孔仪 Bio-rad Gene pulser Xcell、核酸蛋白测定仪 Bio-adSmertSpec plus、蛋白电泳系统 Bio-Rad protean II Xi 20cm、定量PCR仪ROCHELightcycler 2.0、PCR仪 MJ PT220、离心机 Heraus Biofuge stratos、Legend T s/n、全自动消毒机Sonyo、生物安全柜 KS9 PS12、CO2孵箱 Thermo、恒温水箱 Memmert WB10、液氮罐 Cole-tarmer Locator 4等，为临床血液病的诊断和科研提供了强有力的支持。
骨髓检查室具有超清晰度骨髓细胞分析系统，有1名临床医师已成为骨髓检查分析技术专家，每份骨髓检查报告均由一名临床教授审片后共同签字发出，保证了疾病诊断的准确性。
