耳鼻咽喉科是齐齐哈尔医学院附属第二医院重点学科，综合实力全市一流，在市内享有较高的知名度，拥有一支医德高尚，医术精湛的专家队伍。担负着耳鼻喉科教学、科研、临床医疗任务。并取得了可喜的成就。获得多项省市级奖励，多年来，培养了耳鼻咽喉专业学生和进修医生数百名，遍及全国各省市。
耳鼻咽喉科以显微耳外科及耳神经外科手术、鼻科手术以及头颈部肿瘤手术为传统特色和强项。近年来先后引进了鼻内窥镜、大型手术显微镜、微波治疗仪等现代化先进设备，使鼻内窥镜手术、鼾症综合治疗、喉显微手术发展很快，成为新的业务专长。省内外患者慕名而来。
内窥镜手术治疗鼻炎、鼻窦炎、鼻息肉等鼻部疾病已成为常规技术，通过鼻内窥镜治疗一些眼科疾病的鼻眼相关和鼻颅相关手术如鼻泪管阻塞、视神经管减压、蝶鞍区肿瘤切除、脑脊液鼻漏修补等，也已全面开展，有着效果好、面部不留瘢痕的优势。对耳鼻咽喉-头颈肿瘤的诊治，特别是晚期喉（咽）癌，包括手术切除、结构重建及功能重建的水平已达国内先进水平。
开展的手术有中耳炎显微手术、鼓室成形术、人工听小骨植入听骨链重建术、人工镫骨置换术治疗耳硬化症以及全程面神经减压术和面神经移植术、人工耳蜗移植术等。
