青海省藏医院外治科的外治法是藏医四大治疗法中的重要组成部分。《四部医典》在强调藏医治法的顺序时说：“治疗疾病首用饮食法，如不得治愈再用起居法，如不得治再为药也，如不得治终为外治的方法。”
青海省藏医外治科2007年被批为省级特色专科，其中藏医放血疗法已被列为省级非物质文化遗产保护项目。
青海省藏医院外治科的金针疗法：其方法为用黄金制造的粗针扎于白会穴，直立，金针顶上放一艾球许许烧之，以针的热能来达到治疗疾病的目的。可以排除体内积液、脓血、异物及病邪，一般适用于一切“隆病”“培根病”。
青海省藏医院外治科的艾灸疗法：和中医一样，艾灸疗法也是藏医中最常用的外治法之一，就是将艾绒做成大小不一的艾炷，再根据不同的病症，直接或间接地置于人体的穴位上施灸。藏医理论中的“隆”“培根”所转化的一切寒性疾病均适合艾灸治疗。
青海省藏医院外治科的热敷疗法：热敷疗法就是将药物或其他如盐、麻渣、羊粪等物直接加热后敷到体表或是疼痛处，借助药物的功效、温度等物理作用来治病的一种外治法。主治风湿与类风湿性疾病、心脑血管疾病后遗症、肢体运动障碍、皮肤病、外伤性肿胀、剧痛、鼻血不止以及痛风等引起的刺痛、腰腿、四肢肌肉痛等寒性顽疾。
青海省藏医院外治科的油脂疗法：藏医油脂疗法是用食用动、植物油脂或外用涂擦、点滴身体的特定部位，达到治疗疾病、营养滋补，增强体质的目的的一种治疗方法。
青海省藏医院外治科的特色疗法还有金烙疗法、银针疗法、藏药蒸气浴疗法、埋线疗法、铁烙铜烙疗法、藏医按摩、刮痧疗法、蒙古灸疗法等，主攻疾病有痛风、腰椎间盘突出、强直性脊柱炎、骨质增生、肩周炎、高血脂、前列腺炎、中风后遗症、坐骨神经痛等疾病。
