南阳医学高等专科学校第一附属医院儿科分三个病区：儿科一病区（新生儿病区、小儿脑瘫康复病区）、儿科二病区、儿科三病区。
儿科一病区由新生儿病区和小儿康复病区两部分组成，是河南省首批危重新生儿救治网络单位，南阳市重点专科，经过三十多年的发展，病区设备先进、技术力量雄厚、经验丰富，现有专业医护人员50余名，多数在北京、 上海、 广州、青岛、湖南、郑州等儿童医院进修学习。
新生儿病区现有床位70余张，配备有当前最先进的德国西门子呼吸机、无创呼吸机、美国血气分析仪、多功能监护仪、经皮测胆仪、黄疸治疗仪、辐射台、微量血糖仪、微量泵、输液泵、暖箱等先进设备，2008年在南阳市率先开展换血疗法治疗重度黄疸及严重败血症，对早产儿、低体重儿、新生儿呼吸窘迫综合征、肺出血、黄疸、 重度窒息、 胎粪吸入综合征、缺血缺氧性脑病 、颅内出血、脑炎、硬肿症、感染性休克、呼衰、心衰、出血症和溶血症等疾病，抢救成功率达到98%以上。
康复病区配备有脑电仿生刺激仪、数码经络导平治疗仪、痉挛肌治疗仪、肌兴奋治疗仪、高压氧舱等多种功能康复训练仪器。开展项目有：功能训练、语言训练、经络导平治疗、穴位药物注射、头针、电针等多种治疗方法，在豫西南地区首家采用“穴位药物注射”结合小儿康复训练等综合治疗小儿脑瘫、脑发育不良、视力、听力障碍、智能低下、颅内出血、缺血缺氧性脑病后遗症、脑炎脑膜炎后遗症、臂丛神经损害等小儿神经系统疑难疾病均取得了较好的疗效，脑瘫总有效率95%以上，年龄小者可治愈或“正常化”，重症脑瘫可改善运动功能，提高日常生活能力。
儿科二病区是集临床、教学、科研为一体的多功能、多任务学科，南阳市重点专科。擅长治疗小儿肺炎等呼吸系统疾病、心肌炎、心律失常、肾脏疾病、腹泻、脑炎、过敏性紫癜、消化道出血、婴儿肝炎综合征等疾病，疗效好、疗程短、费用低，深受百姓称赞。近年来，二病区开展的儿童哮喘早期诊断及规范化治疗、癫痫的个体化治疗也取得了满意的效果。
儿科重症监护室（PICU）设在二病区，转诊设施完善，实行24小时院前急救服务，危重病人抢救成功率达99%。抢救设备先进，技术过硬。现有美国进口纽邦呼吸机、西门子呼吸机、日本光电除颤仪、惠普除颤仪等一批现代化高精仪器。擅长救治败血症、休克、呼吸、循环衰竭、重症肺炎、脑炎、各种中毒、多脏器功能损伤等急危重病人。
儿科三病区成立于2011年11月，由著名儿科专家陈玉才主任医师任病区主任。科室擅长诊治儿科常见病、多发病以及小儿各系统专业疾病，在神经、循环、呼吸、消化和内分泌等专业方面在市内居领先地位。
