泌尿外科正式建科于1978年，现有专科床位35张，医师9人，其中高级职称2人，博士1名，硕士5名，周一至周六均有专科或专家门诊，每年就诊人数在万人以上。该科是南通市医学重点专科，临床与基础研究处于苏北地区先进地位。
科室配备科瑞达钬激光碎石系统、东芝BK—520体外冲击波碎石机、德国KARL—STORZ尿道膀胱镜、输尿管镜以及气压弹道碎石机、WOLF输尿管肾镜、全套腹腔镜系统、美国顺康(CIRCOM—ACMI)前列腺电切镜、MUF—C型自动尿流率计、美国巴德穿刺活检器，图文工作站。
目前全科以微创泌尿外科、泌尿系统肿瘤为发展主体，同时兼顾男科学、小儿泌尿外科、女性泌尿外科的建设。2004年以来，该科借鉴国内外最新经验，参照AUA、EUA等最新进展，制定了一系列规范化的诊疗指导，在江苏省的泌尿系统规范化治疗中处于先进地位。
科室形成了以腹腔镜手术和结石微创治疗为特色的品牌。腹腔镜手术：肾癌和肾盂癌根治、乳糜尿肾蒂淋巴管结扎、肾切除、肾上腺肿瘤切除、肾囊肿去顶减压、精索静脉高位结扎、以及高难的腹腔镜UPJ成型术和腹腔镜全膀切除及前列腺癌根治术。结石微创治疗：ESWL(体外冲击波碎石术)、URL(输尿管镜下气压弹道、钬激光碎石术)、B超定位下MPCNL(微创经皮肾镜碎石)，使95%以上的结石患者免于开刀的痛苦。上世纪90年代初期，开展了经尿道前列腺电切术(TURP)，已为近千例老年人前列腺增生症患者解除了排尿困难，康复出院快，免除开放手术的痛苦。该科还完成了回肠代输尿管术、回肠可控膀胱术、肾癌根治术、前列腺癌根治术、TVT治疗女性压力性尿失禁，复杂性尿道狭窄手术等大型手术。
近五年来，在国家级和省级杂志上发表论文十余篇，获多项省、市科研成果奖和优秀新技术项目奖，并承担了南京医科大学和南通大学医学院的教学和临床带教任务。接受周边地区进修泌尿外科专科的医师达30余人。
