南通市第三人民医院病理科目前常规开展石蜡切片病理诊断、手术中病理诊断（冰冻切片）、免疫组化、HPV原位杂交等技术项目，年外检量近5000人次（含细胞学）。消化系统及肝病、乳腺病理为科室特色，并结合医院发展重点将肝炎、肝病、肝癌的基因和分子病理诊断作为本科室的业务重点和发展方向。
病理科现有工作人员5名，主任医师、主治医师、医师各1名、技师2名，其中省市知名专家1名、硕士研究生2名。本科室为南通市病理学会副主任委员单位，并且有1人被评为“南通市重点医学人才”及南通市“226高层次人才培养工程”培养对象。
