病理科是闽北最早的病理科之一，病理设备较齐全，目前除承担本院的病理检验外，还承接几家外院的病理标本检验，是南平市医疗纠纷定点尸检单位。开展的项目有常规病理切片诊断，冷冻切片病理诊断，宫颈液基细胞学涂片，穿刺细胞学，脱落细胞学，免疫组织化学染色，特殊染色，原位杂交技术等。
近年来技术组先后荣获南平市病理学分组织的常规病理切片比赛第二名、第一名，福建省病理学分会组织的病理切片比赛第一名、四等奖，2008年分别获得中国病理工作者委员会及福建省病理质控中心颁发的免疫组织化学染色质量认证证书。与各临床医技科室协作开展科研活动，曾与临床学科一起荣获南平市科技进步奖4项，发表学术论文15篇，其中3篇在中华系列杂志上发表。医师和技术员先后在北京友谊医院、福建省立医院、协和医院、省肿瘤医院病理科进修学习。
