传染科成立于1976年5月。由原上海市第五人民医院内科肝炎病房发展而成，1985年从市五医院划出，正式成立闵行区传染病医院、闵行区结核病防治所，设床位130张。主要承担闵行区及周边地区各型肝炎及其它感染性疾病的诊治工作。1988年8月与上海红十字会肿瘤专家咨询服务中心联合成立闵行分中心。同年，又与华山医院建立联合病房。1990年底建筑新的传染病医院，于1992年9月正式使用，设床位132张。1995年10 月原闵行区传染病医院重新并入市五医院设立为传染科，2003年4月传染科再次搬入病房条件更加合理完善的新病房大楼，继续收治各种肝病及其它感染性疾病
多年来，在传染科新老医护人员的共同努力下，大多数高年资医生都是上海慢性肝炎防治研究中心委员，经常参加全国大型传染病学术会议及国际肝病研讨会，及时了解国内外诊治肝病的最新动态，并积累了丰富的肝病治疗经验。在“抑制慢性肝炎病毒复制，消除或减轻肝脏炎症与坏死，预防肝纤维化”等许多领域与国际先进水平同步。科学的治疗方法及良好疗效赢得了广大患者的信赖。前来就诊患者除闵行区外还有不少周边省区患者，如江西、浙江、厦门、奉贤、浦东等地。重型肝炎是肝病治疗的难点，病死率高达50~70%。近年来，我科在重型肝炎治疗方面采取抗病毒与加强综合治疗相结合，疗效显著，病人好转、治愈率在60%以上。2003年10月，一例重型肝炎患者从福州到本科住院治疗，入院时病人总胆红素608.4umol/l，PTA 28.4%,并伴有肝肾综合征、肝性脑病、自发性腹膜炎、克雷伯肺炎等多种严重并发症，经我科医护人员的全力抢救治疗，两个月后，患者康复出院。
医疗、科研、教学协调发展，互相促进。90年代起我科在国家级核心期刊累计发表学术论文20余篇，不断开展新的医疗项目，如：（1）抗病毒药物单独或联合或续惯治疗慢性病毒性肝炎；（2）思美泰联合中药治疗“难治性重度淤疸”；（3）多巴胺+速尿治疗顽固性腹水；（4）用免疫调节、抗病毒等治疗早、中期重型肝炎；（5）去甲肾上腺素、特利加压素治疗肝肾综合征；（6）中西医结合治疗脂肪肝、酒精性肝炎等肝脏损害等。并开展一秒钟快速细针肝脏穿刺检查，提高了肝病的诊断水平。80年代起，我科即与华山医院肝病研究中心建立了密切联系，现每周都有华山医院教授进行教学查房及专家门诊。
按照卫生局要求完善独立的肠道门诊，有严格的消毒隔离制度及独立的病房，成功的救治了多起细菌性食物中毒。同时，应用调节肠道微生态药物治疗各种急慢性腹泻，明显缩短了病程，减少了抗生素的用量及不良反应的发生。2003年5月设立“非典”病房，共排查“非典”疑似病人37名，其中1名确诊为上海市第6例输入性非典病人。经过多年逐步完善，传染科的临床诊治水平和管理经验有明显提高，对各型病毒性肝炎、疑难重症肝病、不明原因黄疸，不原因发热，活动性肝硬化均有较高的诊治水平。
现有医护人员34人，医生共13人，其中，副主任医师2人，主治医生6人，住院医生5人，护士共21人。病房床位56张，有3人间及单间特需病房，所有病房宽敞明亮，温欣舒适，各项设施配备齐全，能为患者提供高质量的医疗服务。
