肾脏科是南京市重点临床专科，南京医科大学儿科医学研究所的临床基地，拥有专科床位35张。本专业主要从事血尿、急慢性肾炎、肾病综合征、过敏性紫癜和紫癜性肾炎、急慢性肾衰竭、狼疮性肾炎、溶血尿毒综合征、肾小管酸中毒、肾性佝偻病等儿童肾脏疾病的临床诊断、治疗和预防工作。年诊治肾脏专科病儿6500人次，病房年收治病儿1500人次，病员覆盖江苏及周边省市，治愈好转率达97%以上，医疗水平具国内先进水平。 科室同时设有血液净化室、肾脏病实验室、免疫室及肾病理检查室。
