肛肠外科建立于1986年，1993年被确定为本院重点专科，同年被内江市卫生局批准为内江市“肛肠疾病防治中心”，1997年增加普外一组。由国务院政府津贴享受者、全国劳模、内江市有突出贡献杰出人才、人称“袁肛肠”的袁万顺主任医师领衔，经过20多年的发展，逐步壮大，已发展为技术力量雄厚，设备仪器先进专业性强的特色科室。
现有医务人员19人，其中主任医师1人，副主任医师1人，副主任护师1人，主治医师4人，住院医师2人，副主任护师1人，主管护师6人，护师3人，护士1人，拥有床位50张，配有日本进口数码电子肠镜1台，日本进口腔内电灼切除治疗仪1台，红外线腔内治疗仪1台，远红外线治疗仪普通型3台、坐式2台，直肠镜、乙状结肠镜各1台，PC9000和PC1200型重病监护仪各1台，远红外线乳腺诊断仪1台等先进设备，为疾病的诊断治疗提供了有利的条件。
科室管理规范，制定有大肠癌手术前准备标准等操作规程和工作制度，能接受各地病人的专科疑难病的诊治，同级医院的专科疑难病转诊、会诊、手术，指导下级医院开展专科疑难、危重病人的手术和新技术，能开展直肠癌、结肠癌根治术，低位直肠癌根治原位肛门成形术全大肠切除术，乳腺癌根治术，甲状腺癌根治术，全胃切除术等手术，吸引了省内外众多的直肠癌患者前来就治。承担本地专科医师的进修和泸州医学院等高等院校的实习任务。开展多项科研，其中低位直肠癌根治原肛门成形术1993年获四川省政府科技进步三等奖，经腹膀胱B超对直肠癌的诊断研究和肠道手术后废除胃管的研究分别获1992年、2001年内江市政府科技进步奖三等奖和二等奖。
全科人员怀着满腔的热诚，精益求精的工作态度，全心全意为病人服务，得到了广大病人的好评，并且连续几年被医院评为先进科室及文明科室，2006年护理组被评为四川省卫生系统护理专业巾帼文明岗、医护人员评为内江市第二人民医院青年文明号。
