解放军94医院肛肠外科是医院的特色专科，也是全军少数设有独立肛肠外科专科的医院之一。现担任全国肛肠学会理事1人，全军肛肠学会理事1人，江西省肛肠学会常务理事1人，主任医师1人，副主任医师1人，展开床位60张，每年收治省内外及军内大量肛肠疾病患者，有肛门测压，全电脑肛肠治疗仪等先进检查治疗仪器。
