南昌大学第二附属医院心胸外科是江西省心脏大血管外科和普胸外科的发祥地。心脏大血管外科专业于2003年被江西省卫生厅确认为江西省医学领先专业学科。本学科目前是江西省培养心脏大血管外科专业人才的中心，是江西省第一批获得外科学（胸心外）硕士学位授予单位，现拥有博士生导师2人，硕士生导师6人，先后培养胸心外科专业博士研究生4名，硕士研究生30余名，培训省内外胸心外科医生100余人，为省内各级相关医院胸心外科的建设和发展作出了巨大的贡献。
本学科设备齐全、技术力量雄厚，现占地面积986.5平方米，拥有床位46张和13个心脏外科ICU床位。现有主任医师、教授5名，副教授、副主任医师6名，医学博士5名，医学硕士12名，留学归国人员4名。在各级科学技术协会担任职务的有：江西省胸心外科学会名誉主任委员1名，副主任委员一名，江西省心脏重症专家委员会主任委员一名，中国医师协会心血管外科分会全国委员一名，中华心胸血管外科学会全国青年委员一名，江西省心电协会常务理事一名，中国心脏重症专家委员会常务委员一名。
心脏大血管外科专业从上世纪50年代末完成第一例心脏手术以来，手术数量逐年增加，现年手术量1000例左右。心脏瓣膜疾病及先天性心脏病的外科治疗一直作为传统优势项目，心脏瓣膜手术量2015年、2016年连续两年稳居全省首位。冠心病的冠脉搭桥术、心脏病的微创手术、房颤的外科治疗、大血管疾病介入及手术治疗、心脏瓣膜成形术均作为常规性工作开展，并开展了心脏移植、左心室减容术，胸腹主动脉替换术、复杂先天性心脏病的矫治等代表国际水平的高难度手术。
本学科在科研方面成绩显著，作为南昌大学医学院的研究平台拥有江西省分子医学重点实验室和南昌大学医学院心血管研究所，先后获得包括科技部重大攻关项目，国家“863”青年科学家专题项目以及国家自然科学基金在内的各级科研课题30余项，总经费达600余万元。获得江西省科技进步奖等各类奖项5项，鉴定成果10项，发表论文百余篇，出版专著3部。
科室医疗特色：
心脏瓣膜疾病及先天性心脏病的外科治疗一直作为传统优势项目，心脏瓣膜手术量2015年、2016年连续两年稳居全省首位。冠心病的冠脉搭桥术、心脏病的微创手术、房颤的外科治疗、大血管疾病介入及手术治疗、心脏瓣膜成形术均作为常规性工作开展，并开展了心脏移植、左心室减容术，胸腹主动脉替换术、复杂先天性心脏病的矫治等代表国际水平的高难度手术。其中冠脉搭桥术，瓣膜成形术，大血管疾病手术治疗处于江西省绝对领先地位。
1. 先天性心脏病：房间隔缺损、室间隔缺损；肺动脉狭窄；动脉导管未闭，法乐氏四联症等。
2. 各种复杂性心脏病治疗：右室双出口；法乐氏四联征；完全性肺静脉异位引流；主肺动脉间隔缺损；心内膜垫缺损；大动脉转位等。
3. 心脏瓣膜病：各类瓣膜置换术及瓣膜成形术。对感染性心内膜炎的手术治疗有独特之处。
4. 心房纤颤的外科治疗：具有安全性好、成功率高等优点。
5. 先心病合并肺高压：我科对肺高压的有15年的系统研究，取得较好的成绩。
6. 大血管疾病：主动脉夹层全弓置换加象鼻支架植入术，马凡氏综合症Bentall手术，胸主动脉瘤根治术，主动脉夹层介入手术。
7. 微创心脏手术：微创瓣膜置换，微创瓣膜成型术，微创先天性心脏病矫正术。
8. 冠心病：常规开展冠脉搭桥手术。
9. 心脏移植：我科于2002年率先在江西省内开展心脏移植手术，目前保持着江西省内心脏移植术后存活最长时间的记录。
