本科包括心血管、风湿免疫和内分泌代谢病三个专业。现有床位47张。
心血管内科：该学科拥有一支高学历、高素质、充满活力的专业技术队伍，现有主任医师3人、副主任医师2人，其中医学博士1人、硕士1人。开展各种小儿心脏病的内科诊治及小儿先天性心脏病心导管诊断和治疗。对后天性心脏病的治疗包括心肌病、心肌炎、心力衰竭、心源性休克、各种心律失常等，具有较高的诊治水平。该科在宁波市率先开展了小儿先天性心脏病的介入治疗，可从事包括房间隔缺损、肺动脉瓣狭窄、冠状动脉瘘、主动脉缩窄、动脉导管未闭、隔离肺、室间隔缺损等的介入治疗。学科带头人邱海燕现任宁波妇女儿童医院副院长。
内分泌代谢病专科：内分泌代谢病专科组建已有十余年，现有正高级专科医师2人；副高级专科医师2人。曾分别进修于上海新华医院、上海瑞金医院、浙江大学医学院附属儿童医院的内分泌专科。十余年来，该专科专家医师每年都保持与全国享有很高威望的儿科内分泌专家的密切联系，不断交流专科学术问题，以其获得专科领域各种疾病的新技术，新进展，并用于临床。目前，内分泌代谢病专科门诊工作量达到了儿科各专科工作量的前列。（周二下午；周四上午；周六全天；周日全天为内分泌代谢病专科门诊时间）。已经开展了儿童性早熟不同时期的治疗、实验室的检查。不同时期的矮小儿童的诊断、治疗。甲状腺疾病、糖尿病、先天性卵巢发育不全等有了成熟的治疗经验。对儿童肥胖症也有了新认识。属于内分泌代谢病专科的危重症可收入专科病房由内分泌代谢病专科医师负责诊治，内分泌代谢病专科将与儿科其它专科并驾其驱，不断总结专科疾病的治疗经验，更好的为病人解决疾苦。
小儿风湿免疫科：本院设有小儿风湿科专科门诊和专科病房（每周日上午专家门诊，每周四下午特需门诊，专科住院床位15张），已开展诊治疾病有：幼年类风湿性关节炎，幼年强直性脊柱炎，幼年脊柱关节病，反应性关节炎，风湿热，系统性红斑狼疮，儿童皮肌炎，儿童白塞氏病，川崎病，过敏性紫癜等各种自身免疫性疾病，另开展了由于免疫紊乱引起的各种过敏症和反复呼吸道感染等。目前，对幼年类风湿性关节炎、幼年强直性脊柱炎、幼年脊柱关节病等开展了生物制剂治疗，近期观察取得较满意疗效。
