中西医结合内科原名康复科，2001年3月更名为中西医结合内科，以收治肝病为主，并利用中西医结合优势，收治内科常见肠胃病、胆道病、老年病、肿瘤等部分慢性病病人，承担传染病门诊工作。为适应科室发展的需要，2008年新建了一幢相对独立的三层病房楼，其中一楼开设发热门诊、肠道门诊、肝炎门诊，二楼收治肝病，三楼为肿瘤病区，基本上形成三区（感染病专科门诊区、肝病区、肿瘤区）三组（感染病组、肝病组、肿瘤组）的布局，整个病区的建筑结构布局合理有序，充分体现了消毒隔离的原则，为广大患者的治疗康复提供了最佳的环境。
该科现有编制医生8人，其中高级职称2人，中级职称4人，初级职称2人；本科毕业生7人，硕士研究生1人。2001年始医院引进肝病专家杨守平主任医师，先后特聘全国著名肝病专家，上海复旦大学附属中山医院胡德昌教授担任临床顾问，特聘全国著名肝病病理学专家，博士生导师，上海复旦大学医学院病理系胡锡琪教授担任病理学顾问，为该科的临床及科研工作做出较大贡献。该科已承担有温州市科委科研课题1项，温州市卫生局科研课题3项，乐清市科委科研课题1项。已发表论文30多篇，其中中华医学系列杂志论文6篇，有8篇论文分别获温州市、乐清市自然科学优秀论文一、二、三等奖。2002年8月，乐清市科技局、市卫生局批准该科成立乐清市中西医结合肝病研究所，2004年12月乐清市市卫生局批准为乐清市医学重点专科，2005年10月温州市卫生局批准为温州市医学重点扶持专科，2008年5月被温州市卫生局纳入温州市“311”工程医学重点专科。
肝穿刺活检和中西医结合治疗肝病是该科最为鲜明的专科特色。已成功进行了400余例肝穿刺活检，无一例并发症发生，在胡锡琪教授帮助下，使许多疑难肝病得到正确的诊断，达到三甲医院的诊断水平。应用中西医结合方法，已成功抢救了130余例重型肝炎，肝硬化并大出血，肝性昏迷病人，治疗了许多难治性肝炎患者；科室自创的中药方剂对酒精性肝损害、脂肪肝也有独特的疗效，中西医结合专家郑可飞副院长被评为温州市 “551工程”学科带头人，乐清市“拨尖人才”。
目前，该科继续跟踪上海的先进医疗技术，在“高、新、尖”项目上下功夫，汇融中西医之长，在进一步巩固肝病专科特色的基础上，开展中西医结合治疗肝癌等肿瘤的临床研究，造福于广大患者。
