儿科是浙江省县级医学龙头学科，温州市重点专科，基础扎实、梯队健全、技术力量雄厚、医教研全面发展的学科。儿科病房共设有床位120张，分为普儿病区与新生儿病区，年门急诊量约33万人次，年住院数5000余人次。科室技术梯队分布合理，拥有主任医师3名，副主任医师9名，主治医师21名，专业硕士8名。学科注重骨干专科人才的培养，派主治以上骨干医师赴美国、北京、上海、杭州等地著名儿童医院进修深造，为学科更好地发展打好基础。
科室主要医疗设备有斯蒂芬尼高频呼吸机、Diger Babylog8000呼吸机、Diger Evita 4 、西门子Servo i 呼吸机、全套菲利普中控心电监系统、CPAP无创呼吸机、3台Diger婴儿培养箱、Diger及阿童木新生儿抢救台、婴儿高压氧舱、新生儿血气分析仪、床头X光机、床头B超、胆红素测定仪、微量血糖监测仪、5年内陆续购置的30台全部配备单面蓝光国产婴儿培养箱、4台双面光疗箱、、蓝光毯、蓝光床、进口微波输液泵、泵式雾化仪和超声雾化仪、床头可调负压吸引及空氧混合装置、转运暖箱和进口简易转运呼吸机等。
近几年与上海儿科医院、上海儿童医学中心等加强了横向联系，2006年成立了“乐清市妇儿诊疗中心”、“乐清市新生儿急救中心”、“乐清市围产医学中心”，全国著名儿科专家沈晓明教授、小儿心脏内科及介入专家孙锟教授、新生儿科专家陈超教授分别担任中心的顾问，指导学科发展中的各项高新技术，设有温州市儿科重点实验室。学科先后开设的特色门诊有：小儿呼吸及哮喘专科、小儿消化专科、小儿心血管专科、小儿神经专科、小儿内分泌及肥胖专科、新生儿专科和小儿心理、行为治疗、智力测定等。
科室注重临床应用与基础研究密切结合，注重利用综合性医院的优势进行跨学科合作研究，广泛开展省内外学术交流与合作。除对新生儿、呼吸、消化、神经系统疾病有非常成熟的诊治流程，同时针对小儿遗传代谢病、肾小球疾病、心肺血管疾病、小儿危重症、小儿内分泌疾病等的发病机理、诊断及防治，从群体到个体、从宏观到微观均开展了系列的研究。近五年来，主持温州市科技计划项目多项，并在国家级、省级杂志发表科研论著二十余篇。全科工作人员齐心协力，以安全医疗为中心，在医疗管理上实行主诊医师负责制，危重病人由科主任、护士长亲自把关，实行严格的三级查房和交接班制度，加上周密细致的护理，使一个个患儿得到了满意的治疗。
