为了达到首次治疗的科学、合理、规范、防止给继续治疗造成困难，提高患者的生存质量，提高治愈率，1992年成立了肿瘤科。专门选择了以诊断和治疗乳腺癌、乳腺良性疾病（乳腺小叶增生、良性肿瘤等）；甲状腺瘤（甲状腺良性肿瘤、甲状腺癌、甲亢等）；结肠癌、直肠癌；及部分软组织肿瘤等为主的外科手术专科。在规范肿瘤外科手术要求的同时，开展了新辅助化疗（手术前化疗）、动脉灌注化疗、手术后的辅助化疗和生物、免疫治疗；手术后腹腔灌注化疗；手术后复发、转移以及晚期肿瘤患者的化疗等。形成了一套非常规范的化疗治疗常规，并做到了化疗的个体化。紧跟国内外肿瘤治疗的新进展，根据肿瘤的生物学特性，临床分期、病理类型以及患者的个体情况，选择治疗方案，合理安排治疗顺序。通过综合治疗提高了手术切除率以及治疗效果。对于术后复发、转移、晚期患者采取综合治疗，提高病人的生存质量，延长了生存期。治疗已经达到国内先进水平。肿瘤专科的综合治疗和生物治疗方面的优势，让更多的肿瘤病人得到规范的、更好的治疗，提高了治疗恶性肿瘤疗效。经云南省卫生厅2006年批准成立了云南省第一人民医院肿瘤综合治疗中心。
科室现有主任医师2名，副主任医师2名，主治医师5名，医学博士1名，住院医师1名，主管护师4名，护师5名，护士6名。均分别到中国医学科学院肿瘤医院，中山大学肿瘤医院接受过专科培训。
专科特色：甲状腺外科手术、乳腺专科、直肠癌外科治疗、肿瘤的免疫、生物治疗。
