眼科中心，是由清末美国基督教会“美以美会所”创立的眼科诊所发展而来的。“同仁眼科”在国内眼科临床领域有着首屈一指的学术地位，曾经为几代党和国家领导人进行了眼科疾病的诊疗，并得到了他们长期的信赖。百年积累，春华秋实，几代眼科医护人员以精湛的医术和良好的信誉打造了同仁眼科长盛不衰的金色品牌。今天，昆明同仁医院传承了同仁眼科百年的技术积累，并引进了当代先进的设备，打造了中国顶级的眼科诊疗技术。
医疗设施
Zeiss-OPMI Lumera显微镜、Alcon-Accurus 玻璃体视网膜手术系统；
Alcon-Laureate 白内障超声乳化系统；
TOPCON的非接触眼压计及全自动电脑验光仪和综合验光台；
角膜内皮细胞镜、非接触眼压计、角膜地形图、角膜曲率、准分子激光机、ZEISS视野计、ZEISS的共焦激光视网膜断层扫描仪和视网膜/脉络膜联合造影系统；
德国罗兰的眼电生理仪、ZEISS相干段层扫描OCT、澳大利亚YAG激光；
美国科医人的532激光、810纳米半导体激光。
