本院于五十年代建院起就建立独立的新生儿病室，至今已有50多年的历史。1983年筹建监护中心包括新生儿重症监护中心（NICU）和儿科重症监护中心（PICU），PICU现已并入急诊科。1996年医院正式成立新生儿科，1998年，新生儿科被卫生厅确定为浙江省医学重点学科。本科技术力量雄厚，现有教授2名，主任医师6名，副主任医师6名，主治医师4名，其中有教授2名，博士生导师2名，博士5 名，硕士8 名；科室还拥有技术精湛、服务优良的专业护理人员50余人。
新生儿科目前共设两个病区――NICU及新生儿病区。每年收治的新生儿数约4000人次。NICU病区共有床位35张。对各种高难度危重病人如各类严重呼吸衰竭、重症肺透明膜病、持续肺动脉高压、严重胎粪吸入综合征等治疗方面具有丰富经验及良好治疗效果。病区配备各种高档常频及高频呼吸机，开展肺表面活性物质及一氧化氮吸入疗法。超、极低体重儿存活率>87％，最低存活者体重为650g。新生儿病区拥有约90张床位，分普通病室及呼吸道隔离室、消化道隔离室。每个病室有单独的淋浴室，同时配备中央空调系统、新风系统。本科室配备心肺监护仪、经皮氧饱和度监测仪、辐射式新生儿抢救台、蓝光治疗仪、空氧混合头罩等设备，每张床均配备输液泵。能开展各种常见病、疑难病症及危重新生儿的诊断和治疗。并进行新生儿听力筛查、新生儿抚触等诊疗技术。
新生儿科已连续5年承担国家继续教育项目。NICU作为新生儿监护的培训中心为院内培养NICU人员50余人，为省内及国内培养NICU人员100余人；新生儿科每年还接收十余名来自省内外的新生儿专科医师进修。
