江苏省妇幼保健院儿科是“十一五”江苏省重点学科儿科学的重要组成部分，是南京医科大学博士、硕士学位授予点，博士后流动站点。目前儿科拥有一支结构层次合理的学术队伍，现有医护人员83人，其中教授2人、副教授7人、博士生导师2人，硕士生导师4人；主任医师10人、副主任医师8人、副主任护师2人、主治医师10人，是中国医师协会新生儿科医师分会委员、中国妇幼保健协会新生儿保健专业专家委员会委员、江苏省新生儿科医疗质量控制中心副主任、江苏省中西医结合学会儿科分会主任委员、江苏省医学会儿科分会委员等所在单位，拥有江苏省“135”重点人才、江苏省“兴卫工程重点人才”、江苏省“重点医学人才（联合共建）”各1人。
儿科病房面积2300m2左右，分为儿一与新生儿科2个单元，开放床位90张。设有新生儿、血液肿瘤、感染（呼吸，消化）、内分泌、心血管、风湿免疫等6个亚专业。其中新生儿科是省厅妇幼重点学科，小儿内分泌、感染专业是国家药物临床试验基地。
儿科是一个集临床、科研、教学于一体的学科。承担着南京医科大学儿科学教学任务。科研方面也取得了显著成绩，承担着7项国家自然科学基金及省社会发展基金、1项教育部博导类博士点基金项目、3项省厅科研基金及2项省卫生厅重点人才项目。发表数十篇SCI收录论文和高质量的核心期刊论文。主编多部儿科临床专著、儿科手册及多种儿科参考书籍。获多项省、厅、市级科技成果奖及省厅新技术新项目引进奖。
