济南市中医医院肛肠科成立于上世纪70年代，作为济南市较早开展肛肠疾病诊治的三所公立医院之一，有着悠久的传统，至今以有将近四十年的历史，集临床、教学、科研于一体。肛肠科门诊位于门诊三楼，病房在病房楼七楼。科室现有工作人员5名，其中副主任医师2名，主治医师1名，住院医师1名，专科护师1名；具有硕士学历2名。科室人员配备梯队合理，技术力量雄厚，具有较高的临床科研和带教水平。科室以中西医结合，突出中医特色为立足点，主治各期内痔，外痔，混合痔，肛裂，肛瘘，肛周脓肿，直肠脱垂，炎性肠病，功能性便秘，结直肠息肉、特异性肛门疼等肛肠科常见疾病。同时，依托医院先进的超声诊断仪、西门子128层螺旋CT等大型设备对脓肿的大小及定位，肛瘘瘘管的走形做出准确的诊断，电子结肠镜、高频电刀、激光仪等保障了在疾病的诊断治疗过程中与世界接轨。现任科主任孟泳副主任医师，擅长肛肠科常见病、多发病的诊断治疗，尤其痔病的微创、无痛治疗，电子肠镜检查与常用镜下治疗技术如结直肠息肉的EMR治疗。
微创注射治疗是肛肠科特色疗法之一，在济南市率先开展应用微创注射疗法治疗各期内痔、混合痔，疗效显著。其原理是把中药制剂直接作用于痔核上，使其萎缩脱落，其优点在于治疗当中无痛苦、时间短，愈后恢复快等特点，至今治愈上万例，获得广大患者的良好反响。在治疗脱肛，直肠粘膜脱垂方面，注射治疗效果更为显著。
科室自行研发了纯中药药品九华膏等外用药膏，消肿止痛汤、祛毒汤，苦参洗剂通过熏洗治疗临床上取得较好的效果。
