济南市儿科医学研究所于2007年9月26日经济南市科学技术局批准成立，机构设在济南市儿童医院(山东大学齐鲁儿童医院)，主要从事儿童保健、儿科疾病、医疗、教学及预防任务的应用医学研究。现有工作人员12人，其中教授4人，副教授2人，博士研究生导师1人、硕士研究生导师5人，博士2人，硕士2人。具有较强的科研和临床能力。
根据济南市形势的发展、群众的需求、结合我市临床医学所需及儿童医院特色，暂设立病原微生物学实验室、血液-干细胞实验室、遗传代谢病实验室、分子生物学实验室、分子免疫学实验室、生长发育实验室、内镜室7个重点研究领域。建立多个实验平台，如细胞培养平台、病毒培养平台、免疫研究平台、PCR平台、分子克隆平台、蛋白纯化平台、遗传代谢病筛查与诊断平台、基因研究和检测平台、干细胞研究平台、儿童生长发育监测平台、内镜检查与介入治疗等多个开放实验平台。引进低温离心机、程控降温仪、流式细胞仪、荧光PCR仪、凝胶成像仪、酶标仪、倒置显微镜、串联质谱色谱仪等大型仪器设备。近2年拟投资1500万元，建成1000平米功能齐全的济南市儿科医学研究所，为全市、全省儿科医学事业服务。
一.儿研所的目标：
1、建立科研平台：儿研所工作中心是搭起临床与应用基础医学研究的桥梁，开通临床与基础医学之间的绿色通道，面向全院、全市、全省开放。
2、研究生培养基地：为我院、我市硕博士生培训工作建立良好的科研平台。加速科技发展，增强我市的科技竞争力。
3.高起点、高水平、高效率的创建良好的科研环境和实验条件，成为我市乃至我省儿科实验开放基地、科学研究和学术交流的平台及科技对外开放的窗口。全面提升我市儿科疾病防治水平持续、快速、健康发展，发挥整体优势，担负起国家、省、市卫生科技重点攻关项目，使其成为我市医学科技创新、人才培养、学术活动、临床研究的平台和基地。
二.重点研究方向：
1.病原微生物学实验室：
对临床的常见病、多发病及疑难病进行病因、病原的研究，提高诊断水平，服务于临床治疗，结合儿童医院为全市流感及病脑监测点及儿童疾病的季节流行特点，提高临床综合防治水平，加强我市传染病防治的应变能力和超前意识，加强预测、预报和疾病监测。
2.血液-干细胞实验室：
建立血液-干细胞研究中心，开展骨髓细胞学及出血性疾病的诊治研究;白血病肿瘤的相关检测诊治研究;干细胞基础与临床应用研究。
3.遗传代谢病实验室：
采用现代细胞遗传学、分子遗传学、细胞生物学和生物信息学技术相结合的手段，研究某些疾病的遗传基础及其发病机制，达到早期诊断、早期干预、早期治疗的目的。开展遗传代谢疾病的筛查与诊断;遗传性疾病的染色体诊断、基因诊断;开展基因门诊，遗传代谢病咨询;内分泌疾病等激素与遗传代谢的研究。
4.分子生物学实验室：
建立分子克隆平台、蛋白纯化平台、基因研究和检测平台、芯片平台，为临床和科研工作服务。开展哮喘等疾病基因突变和蛋白表达研究;儿童聋病相关遗传因素诊断与防治研究。
5.免疫学实验室：
提供免疫学研究和检测，包括：流式细胞术、过敏原检测、细胞因子等分子分析平台、体液免疫/细胞免疫检测、免疫组化、免疫荧光等技术研究免疫相关性疾病。
6.生长发育实验室：
开展儿童心智研究：研究儿童智力发展规律及促进，高危儿体格、智力、心理发育的促进和发育异常的预防，常见儿童心理疾病、儿童心理行为异常的诊治等;儿童营养研究; 流行病学研究：研究儿童健康状况、环境因素、环境激素与儿童健康的关系，儿童生长规律及生长标准的研究与制定，青春期生长速率与性发育的研究、各种疾病及心理行为问题等流行病学调查。
7.内镜室：充分发挥我省独有的超细电子支气管镜和无痛胃镜技术，为临床解决疑难问题。
支气管镜室：开展电子支气管镜局部麻醉检查术或无痛检查术、肺泡灌洗术、异物取出术、黏膜活检术、支气管镜下激光、冷冻、电凝、氩气刀、球囊扩张、支架植入，胸外科手术前定位，气管镜引导下气管插管等。肺泡灌洗液的常规检查和细菌学培养。
胃镜室：开展电子胃镜检查术局部麻醉检查术和无痛检查术，黏膜活检术，异物取出术，氩气刀治疗术，支架植入术。肠镜常规检查术，黏膜活检术，氩气刀治疗术等。
