结核科前身为肺科病区，创建于1956年，2000年成立杭州市结核病治疗中心，是全国传染病临床基地、浙江省规模最大的结核病定点诊治医院，床位数从2000年的60张扩大至现在的106张，2006年6月结核病专科重症监护病房(ICU)投入使用，为国内第一家结核病专科重症监护病房，现有监护病床11张。2004年被批准为“浙江省中西医结合传染病(结核病学)重点扶植学科，2007年被列为浙江省卫生厅中医名科建设科室;同年被列为杭州市医学重点专科。2008年4月份以优秀的成绩通过浙江省中医药管理局考核。
研究方向 中西医结合治疗耐药肺结核；中西医结合治疗淋巴结结核；中西医结合治疗抗痨药引起的药物性肝损害；减轻抗痨药引起的一系列毒副反应，起到减毒增效的作用。支气管镜的检查与治疗，开展的项目有支气管镜下的肺泡灌洗术、支气管镜下穿刺术、明显的提高了诊断与鉴别诊断水平；支气管镜囊性扩张术、支气管镜下冷冻术治疗支气管结核，缩短了病人的病程，明显的改善的支气管结核病人的预后，提高了生活质量。
随着我科技术水平的不断提高，在省内外享有较高的声誉，在全省具有技术示范作用，硬件规模和技术水平全省领先，06年派出专家会诊达280余次，技术骨干外出讲课达10余次，区域外病人占35%左右，并接纳省内下级医院进修医师。06年成为浙江省中医药大学硕士点，拥有硕士生导师一名，招收研究生1人。
科研论文 近年来共发表论文40余篇，省市级课题13项，结题4项。参与国家十五攻关课题一项，已通过鉴定。浙江省中医药管理局课题“浙江省耐利福平rpoB基因突变的研究”(项目编号：2003CO69)通过成果鉴定，达到国内先进水平。
《疏肝解毒利湿化瘀法对利福平所致肝损伤的保护作用”》(项目编号：0623002)获2007年浙江省中医药科学技术创新三等奖及2007年浙江省科技三等奖。扶土抑木法预防抗结核药所致肝损害的临床研究》省中医药管理局2007WB025结核分枝杆菌耐药基因的临床基因检测技术的标准化研究》杭州市科技局2006533Q08。
主要设备：
全自动结核分枝杆菌培养箱(960BACTEGMGIT美国BD公司)
OLYMPUS240电子支气管镜系统，
支气管镜冷冻治疗仪等。
重症监护病房，固定资产投资达300万，具有先进的中心监护系统，7台高档呼吸机。
