消化科历史悠久，由消化病区、消化内镜中心组成。在我市率先开展了电子胃镜，电子结肠镜检查,成立了C14呼气检测幽门螺旋杆菌实验室，开展肠道菌群分析，胃肠内镜活检标本病理学诊断。尤其在无痛镜、无痛肠镜、小儿胃镜、小儿肠镜检查、早期胃癌、胃肠息肉、消化道出血急诊止血等内镜下治疗具有显著的优势和特色，消化内镜诊疗、胃肠肿瘤诊疗、肠道疾病的微生态检测与治疗研究等水平均在自贡及周边地区属领先地位。在我市独家配备了内镜消毒中心，各类内镜检查消毒操作规范严密，病人能够安全放心地检查和治疗。
