市一院医学检验中心现为淮安市重点专科，该中心由检验科、放免中心、中心实验室、输血科4个检验专科组成。另 “淮安市临床检验中心”挂靠我院医学检验中心。
目前，中心共有79名专业技术人员，高级职称15人，中级38人；其中博士生1人，硕士研究生5人，硕士研究生导师3人；省“333”工程培养人才1人，市“十百千”第二层次人才培养对象2人，第三层次人才培养对象1人；江苏省医学会检验分会、微生物与免疫学分会、核医学分会、输血分会等分会委员各1名。淮安市医学会检验分会主任委员1名。
中心拥有全自动生化分析仪、全自动五分类血球计数仪、全自动酶免分析仪、全自动血液培养仪、全自动尿沉渣分析仪、全自动化学发光分析仪、流式细胞仪、实时荧光定量PCR仪、全自动血型分析系统 等各型设备100余台套，价值1700余万元。这些设备的使用极大地方便了临床医师的诊治，为淮安市及周边地区的广大患者提供了准确、及时和安全的服务。
中心首批以高标准通过省卫生厅《检验科规范化医院合格单位》评估验收，现为省临床检验中心 “临床化学”、“临床血液学”参比实验室，卫生部核准PCR合格实验室。
近年来,医学检验中心以自身免疫病组合检测、肝功能异常初筛组合检测、放射免疫、骨髓血液细胞形态学、干细胞采集术、流式细胞术、PCR检测病原体、血型抗体效价、新生儿溶血病免疫学检查等为特色，共开展600余项检测项目。年业务收入近5000万元。
医学检验中心学习、学术气氛浓厚，目前共有多项立项课题，近三年来在省级以上专业杂志发表论文50余篇，其中SCI论文4篇，中华杂志5篇，核心期刊9篇，参与编写专著4部，获得市科技成果进步奖15项，市卫生局新技术引进奖5项。同时还承担淮阴卫生高等职业技术学校和南医大临床系检验课程的教学任务，年接受来自省内外高校和高职学校实习进修人员30余人。
