市一院胃肠外科是江苏省临床重点专科，现有床位705张，医护人员共42人，其中主任医师5人、副主任医师8人、主治医师6人、住院医师6人、博士研究生2人、硕士研究生5人。是全市胃肠外科疾病诊断与治疗中心、全市胃肠外科疑难危重病例会诊中心、全市胃肠外科专业人员培训基地和科研中心。
胃肠外科阵容强大、人才济济、设备齐全、服务一流。除了对常见的胃、十二指肠、小肠、大肠、肛管疾病诊治具备较高的水平外，胃肠外科尚有如下两项特色专科技术：1.在苏北地区率先开展腹腔镜下胃Ca、结直肠Ca根治术及联合脏器切除术；2.苏北地区唯一的肠外瘘治疗中心，该中心已成功治愈多例（包括从苏南地区转入）复杂的肠外瘘患者，深得病人的赞誉。以上两项技术在省内处于先进行列。
该科主任于仁主任医师任江苏省胃肠外科学组委员、江苏省血管外科学组委员、江苏省抗癌协会胃癌专业委员会常委、江苏省营养学组委员、淮安市普外专业委员会主任委员，科副主任张逖主任医师任淮安市普外专业委员会秘书长，科副主任周光荣主任医师任淮安市普外专业委员会委员。
该科近5年来在省级以上刊物发表学术论文40余篇，获省卫生厅新技术引进二等奖1项、发明专利1项、市科技成果三等奖6项。
