四川大学华西口腔医院正畸科是是中国口腔事业重要组成部分，也有着悠久的历史。自1917年起华大牙学院就在牙科教育中开设了'正牙学'课程，主讲教师吉士道（Harrison J. Mullett）是中国口腔正畸学院教育的启蒙人。
早在二十世纪四十年代，华大牙科医院便开始使用'双丝弓矫治器'固定矫治技术，目前该科仍保存有当时使用的点焊机、双丝弓成形器、带环、金合金制作的弓丝和焊金等其它矫治器附件。1947年由华西协和大学牙学院毕业的王巧璋教授在华西坝上建立中国的第一个小儿齿科系，从此开始和她的同仁们一起从事儿童牙病的诊治工作。1949年华大牙学院正式建立正畸科，第一任主任是周少吾教授。中国成立以后，由于院系及学科的调整，儿童牙病学合并到口腔内科学之中。2010年，学院本着与国际接轨、更好的发展儿童口腔医学学科的目标，儿童口腔医学教研室归属于口腔正畸学系。五十年代以前从华西大学院派出学院习'正牙学'专业并学院成归国的有周少吾、毛燮均、陈华、席应中、罗宗赉、邓述高等，他们是我国口腔正畸学院事业的奠基人。
文革以后，重建恢复的华西医科大学院口腔正畸科于1978年被批准为硕士学位授权点、1981年被批准为博士学位授权点、1991年被批准为口腔医学博士后流动站，1996年被批准为全国口腔医学继续教育基地、1997年获卫生部重点学院科建设项目资助、1999年被批准为四川省重点学科。
口腔正畸学系下设口腔正畸学教研室和儿童口腔医学教研室，现有教师30人，其中教授6人，副教授7人，讲师、主治医师17人，其中有博士学位者23人。迄今已培养博士生50余人、硕士生70余人，进修生100余人。作为卫生部首批国家级继续基地，近年来共举办各种全国性、地区性专业培训班数十次。
口腔正畸科近年来共获国家、部、省各级科研项目基金500余万元，各级科研成果奖励10余项，出版专著10余部，国内外期刊发表文章500余篇；接待外宾讲学100余人次，陆续派出20余人出国深造，已有多人学成归国。
目前，四川大学华西口腔医院正畸科共有二个临床诊断室，面积逾400M平方米，30台椅位，常规开展各种固定矫治技术、功能矫形治疗、活动矫治、及各种早期预防和阻断性矫治。形成了与医院各科室定期会诊制度，成立了正畸外科联合治疗小组、牙周病治疗小组、颞颌关节病治疗小组及唇腭裂联合治疗小组，是中国西南部最大的口腔正畸学院临床、教学和科研基地。
四川大学华西口腔医院正畸科，是我国最早成立并开展正畸临床及教学的口腔专业学科。正畸科除开展常规正畸治疗外，还开展了儿童预防及阻断性矫治、正畸外科联合治疗、唇腭裂联合治疗、颞颌关节正畸治疗、正畸牙周联合治疗以及正畸修复联合治疗等。
