根据党和国家发展中医药事业的政策，医院在建院之初就设置了中医科。由于开院之初其他科室人员不足，中医科编制内的医生被选派到传染科、疗养科等科室参加出诊和值班，有的还被抽调出去办护训班和护理班。1981年，属于中医科编制的医生陆续回到中医科。1982年，中医科分设了中医外科、正骨室、中医病房、针灸室，逐步开始走上规范化的管理轨道。1986年分设出了皮肤性病治疗室。2000年针灸室并入疼痛科。2005年撤销了正骨室，相关业务归入创伤骨科。中医科现设置为中医门诊、中医病房（与呼吸内科为同一个护理单元）和皮肤性病科门诊。
中医科能够采用中医、中西医结合疗法各种常见病和多发病，并对多种疑难杂病具有独特的治疗手段。中医门诊和病房先后对哮喘、先兆中风、先兆流产、肾炎、肺炎、肺气肿、肝炎、高血压、冠心病、类风湿关节炎、神经衰弱、脾胃病、痛经、面瘫、呃逆、神经官能症等30多种疾病进行中医、中西医结合治疗的临床观察，总结了许多行之有效的治疗方法。开展了医院立项的科研课题有：《降酶方法疗急慢性肝炎80例疗效分析》《小蓟饮子治疗血尿50例疗效分析》《通络宝治疗颈、腰椎骨质增生80例疗效观察》等。
皮肤性病科是1996年经广州市卫生局性病监测中心批准的性病监测点，备有二氧化碳激光机、电离子治疗仪、液氮、紫外光治疗仪等治疗仪器，开展真菌镜检及支原体、衣原体检测。采用中西医结合方法治疗各种皮肤病和性病，擅长治疗湿疹、疱疹、皮炎、痤疮、扁平疣、慢性荨麻疹以及淋病、非淋菌性尿道炎、梅毒、生殖器疱疹、尖锐湿疣、前列腺炎、带状疱疹、脱发等。开展了医院立项的科研课题有：《皮肤真菌镜检》《综合治疗斑秃30例疗效观察》《中西医结合治疗性病后前列腺炎》等。
针灸治疗室除开展针灸治疗业务外，还开展了艾灸、电针、穴位注射、梅花针、推拿、拔罐等治疗业务。
正骨室以中医手法复位为主，辅以小夹板固定，并开展了中医按摩、中药敷贴等。
中医科建科至今，先后有6名医务人员到上级医院进修学习，参加全国和全省学术会议30人次，发表学术论文数十篇完成医院立项的科研项目项。现有副主任医师2名、主治医师3名。
