1983年在钟南山院士的带领下成立了变态反应科的前身-广州呼吸疾病研究所哮喘与变态反应性疾病专业诊治小组，后于2005年6月正式成立变态反应科，变态反应科标准化变应原研发和实验中心也于同年的9月份成立。变态反应科以李靖教授为学科带头人，拥有钟南山院士、冉丕鑫教授、郑劲平教授、赖克方教授、陈爱欢教授、何梦璋主任、张清玲主任、孙宝清研究员8名学术骨干、专职医生11名，专职科研人员2名，技术人员3名。
变态反应科开展业务包括临床诊断、体内及体外免疫学诊断、肺功能检测、呼吸专科治疗及脱敏治疗等。诊断仪器设备先进，可进行标准化变应原皮肤点剌试验，采用了国际先进的放射免疫方法（Unicap系统）、化学发光发（ADVIA Centaur系统）、免疫捕获法（ALLERG-O-LIQ系统）进行血清特异性免疫球蛋白测定（总IgE及特异性IgE）及其他免疫学指标的检测、肺通气功能及气道反应性测定等检查，对过敏性哮喘及过敏性鼻炎做出准确诊断和治疗，并为经临床筛选合格的患者提供标准化变应原疫苗的脱敏治疗，同时对患者进行系统、规范的综合治疗，亦为治疗的效果进行客观的评估。变态反应科拥有完备的电脑管理系统，对每一个患者建立电子病历档案进行管理。科室还定期组织多种形式的宣教活动，如哮喘之家、建康知识讲座等，提高患者对过敏性疾病的防治认识，进一步改善患者的生活质量。
近年来，变态反应科实验部与丹麦ALK亚太研究部联合建立了标准化变应原研究实验室,该实验室是一个结合临床过敏研究、训练和教育及支持特异性免疫治疗新产品发展的重要平台。目前的实验室的设备主要有变应原免疫电泳设备，免疫印迹设备，酶标仪，化学发光免疫学分析仪，简易的蛋白质纯化系统和冻干设备。在此基础上科室联合完成了多项临床与基础相关项目，例如流行病学及变应原(尘螨)暴露情况的研究和临床疗效的研究、特异性免疫在中国过敏性疾病患者的疗效与安全性以及评价疗效的生物标志物的研究。
变态反应科在技术及管理上达到世界先进标准化免疫治疗中心水平，于2006年便获得IQAP认证。从2012年3月30日开始由香港品质保证局（ISO）对“皮下注射屋尘螨变应原特异性免疫治疗”做第一次管理预评审，2012年7月30日正式通过管理评审并发证，2013年3年1日顺利通过香港品质保证局的第一次复审。
该专科坚持基础医学与临床医学的紧密结合，不断开拓创新，逐步发展壮大。该科共有6个专业组，包括：变应性鼻炎与鼻窦炎、支气管哮喘的规范化诊治、难治性哮喘的表型以及个性化治疗、慢性咳嗽的诊疗规范、真菌过敏相关性肺部疾患、食物过敏以及过敏性皮肤疾患、免疫及变态反应学诊治新技术的研发。
该专科年平均门诊量逾38619人次，接收免疫治疗的变应性鼻炎、哮喘和皮炎的患者年平均有2268人次，年平均住院人数486人次，为国内较大规模的并具有一定影响力的变态反应性疾病诊疗专业机构，收治来自全国各地的、曾就诊过许多大医院的相关疑难病例，甚至外籍患者，包括各种变态反应性疾患、难治性哮喘、嗜酸粒细胞性肺炎、变态反应性支气管肺曲菌病、嗜酸粒细胞增多症、食物以及药物过敏和过敏性休克等。该专科注重提高技术团队的整体诊治水平，还在正式成立之前上世纪80年代开始，定期于周三上午进行钟南山院士疑难病例全院大查房，并邀请相关科室（如影像科、病理科、耳鼻喉科、风湿科、皮肤科、血液科、心血管内科、儿科、心理科等）进行讨论，从整体出发制定有利于患者的最佳诊治方案，解决了大量疑难问题。近3年，科室住院患者疑难危重病例比例约53%，疑难病例治愈好转率90%以上。
变态反应科通过规范化的系统培训，使专科医生不但能掌握变态反应科常见病及危重症：如过敏性鼻炎鼻窦炎、上气道综合征、咳嗽的鉴别诊断与咳嗽变异型哮喘、重症哮喘、食物过敏与过敏性皮炎、过敏性休克与神经血管性水肿的处理，还能熟练掌握变态反应学的临床操作与技能，包括：皮肤点刺实验、鼻咽镜检查与鼻粘膜活检、鼻腔灌洗、诱导痰、支气管镜检查和支气管肺泡灌洗、动脉穿刺与血气分析、胸腔穿刺置管术、危重症患者的呼吸支持与呼吸功能监测、循环支持及循环功能监测、胸部X片/CT读片、胸部V/Q扫描读片、肺功能操作与结果判读、深静脉穿刺置管、有创动脉血压监测、心肺康复技术等。
学科主任李靖作为中国专家参与了世界卫生组织出版的《过敏性鼻炎对哮喘的影响》（ARIA）指南的制订和修订工作，协助钟南山院士牵头制定了“中国特异性免疫治疗的临床实践专家共识”。
承担了科技部“973”计划课题1项、“863”计划课题2项、十一五国家科技支撑项目2项、国家自然基金国际联合项目1项、面上项目6项、青年项目2项、中华医学会慢性呼吸道疾病专项2项，广东省科技厅和科技局等5项科研项目。迄今撰写了100余篇学术论著在国内外著名医学专业杂志上发表，其中SCI收录论文40余篇。取得发明专利1项、实用新型专利8项。“尘螨过敏原诊断试剂盒疫苗的研制及其推广应用”获得了2011年教育部科技进步二等奖，“尘螨过敏原的基础研究及其产业化”获得了2009年广东省科学技术奖励一等奖，“蟑螂过敏原诊断试剂的研制及临床应用研究”获得2010年广东省科学技术奖二等奖。
