呼吸病科在“全国青年女科学家”、“全国老中医药专家学术经验继承人”林琳教授的带领下，在医院“中医学术站在前沿，现代医学跟踪得上，管理水平匹配到位，构建人类完美医学”的建设指导下，以学术发展为纽带，通过不断发展壮大，已成为由呼吸内科、呼吸急症、呼吸重症监护室、胸外科、肺功能室、支气管镜室、呼吸动力室等共同组成的国家中医药管理局重点肺病专科，主持“咳嗽病”临床路径推广及全国试点工作。专科以全国名老专家为顾问，专科人才为核心，基层协作医院为网络的学术平台，在COPD、呼吸衰竭、慢性咳嗽、呼吸道传染性疾病的文献研究、证候规律、疗效评价、中医药传染病防治预案等方面进行深入研究，不断创新，共承担国家级及省部级课题12项，获得1项国家级、4项省部级科研成果，1项发明专利。注重人才队伍建设，培育了一批中医功底扎实、临床技能过硬、科研思维活跃的中青年专科人才，同时带动了区域内中医临床路径优化及实施，在省港澳享有较高的声誉。
专科拥有病床148张，肺功能仪5台，包括体描仪、运动心肺功能仪，电子支气管镜3台，纤维支气管镜7台，有创呼吸机4台，胸腔镜2台、呼吸睡眠监护仪1台等专科诊治设备。已开展气管镜下活检、刷检、TBLA、TBLB、支架放置、氩气刀肿物切除、冷冻技术等呼吸介入治疗技术，经胸腔镜微创诊治技术，肺部高分辨CT，气道重塑以及肺通气、换气功能、残气量测定、气道阻力功能测定、运动肺康复、运动心肺功能检测、哮喘峰流速变异率监测、诱导痰细胞学检查等多项技术，六分钟步行距离、气道阻力等相关技术，具备较高的专科诊治水平。可以诊断治疗支气管哮喘、慢性阻塞性肺病、肺部感染、支气管扩张常见病，以及弥漫性肺间质疾病、肺部血管性疾病等疑难病。
该专科特色浓厚，治疗手段独特，专科制剂多，疗效好，吸引了大量病员。除该市病员外，也吸引了省内外及省港澳患者就诊，取得了良好的社会效益。该科开展了哮喘、咳嗽、肺气肿专科门诊，成立了“慢性阻塞性肺病”、“支气管哮喘”病友会，成立了全国首个中医哮喘联盟。定期为病人讲授有关疾病的防治知识，指导病人治疗、康复及生活调护。
目前开展的中医特色治疗技术包括：砭石、平衡罐、针灸、穴位注射、中药药熨、中药灌肠、中药沐足、中药口腔护理等，对于缓解COPD、支气管哮喘、亚急性/慢性咳嗽等疾病的咳喘症状，促进呼吸道感染性疾病的炎症吸收，以及防治口腔真菌感染等均已显示出显著优势。
专科拥有高级职称医师12名。其中世界中医药联合会呼吸分会副会长1名，中国中西医结合学会呼吸病专业委员会副主任委员1名，广东省中医药学会呼吸分会名誉主任委员1名、顾问1名、主任委员1名、副主委3名、常委3名、副秘书长1名，广东省中西医结合学会呼吸分会副主委1名、常委1名，中华医学会广东省微创外科分会副主任委员1名、常委1名。承担国家“973”子课题1项，“十一五”科技支撑计划1项，省部级课题多项，并同香港、澳大利亚等国际研究团队开展呼吸领域的科学研究。
